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spkeey金虫 (正式写手)
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[交流]
[求助] NBO 轨道和 MO轨道的区别
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我用 1。#p HF/6-31G pop=(NBORead,SaveNBOs,SaveNLMOs) 2。#p HF/6-31G pop=NBORead 3。#p HF/6-31G pop=(NBORead,SaveMixed) 4。#p HF/6-31G pop=(full,SaveMixed) 5。#p HF/6-31G sp ========================== 1。生成的chk文件，在gauss view 中看到的MO轨道分别是什么轨道？ 2。SaveMixed和SaveNBOs,SaveNLMOs连用有什么区别？ 3。NBO 和 NLMO 与 MO 的关系？ 4。我自己认为SaveNBOs后的gauss view中的 MO 就是保存后覆盖的 NBO ，这个想法，是否正确？ 5。不论NBO和SP save后的一致，但和不save的轨道不一致/，一定要save吗？save的到底是什么呢？ ===================== 概念混乱，望大家按问题回答，答对奖励分数。清晰而具体的加分。  ===================== 还问个问题，怎么把图像和 log中的NBO 轨道 的系数 联系起来？如果回答，我另外开帖送分？ [ Last edited by spkeey on 2008-10-14 at 21:40 ] |
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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 5-3 18:08
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1. SaveMixed、SaveNBOs和SaveNLMOs的含义见二楼。我认为SaveNBOs和SaveNLMOs是不能连用的，即使程序没有报错，你也无法控制Gauss将其解释为什么。 2. 默认储存的(既没有加各种save选项的)MO是CMO。 3. 生成的chk文件，在GV中看到的轨道就是你储存的轨道，CMO、NBO或NLMO等。 4. CMO、NBO和NLMO的具体含义请自行查阅文献，NBO的官方网站应该有线索。 5. 各种save选项只是影响chk文件的可视化输出，对out/log中的布居输出没有影响。 |
17楼2009-05-03 15:11:21
xiaowandouer
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lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-3 18:07
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同样迷糊，期待高手给予解答 ################# lz可能已经看过help，我再重新贴一下手册中对lz提到的某几个关键词的说明： SaveNBOs Save natural bond orbitals in the checkpoint file (for later visualization). SaveNLMOs Save natural localized molecular orbitals in the checkpoint file (for later visualization). SaveMixed Save the NBOs for the occupied orbitals and the NLMOs for the unoccupied orbitals in the checkpoint file (for later visualization). ################ 自己对SaveNBOs做了下测验（三重态的氧分子），发现两点不同： 1.加了SaveNBOs后，nbo的输出文件中在alpha电子和beta电子后面多了这么几句话： alpha电子后面： Sorting of NBOs: 2 3 4 7 1 8 9 6 5 10 Reordering of NBOs for storage: 2 3 4 7 1 8 9 6 5 10 Labels of output orbitals: CR CR LP LP BD LP LP LP LP BD* beta电子后面： Sorting of NBOs: 4 5 1 6 7 3 2 10 9 8 Reordering of NBOs for storage: 4 5 1 6 7 3 2 10 9 8 Labels of output orbitals: CR CR BD LP LP BD BD BD* BD* BD* 2.用两者的chk文件看最高占据单电子的MOs时发现所得轨道图并不相同，而输出文件中给出的轨道能是相同的，这是否是由于savenbos得到的是自然键轨道，是定域的，而没有save的chk文件得到的是分子轨道理论中所提到的那个分子轨道（该轨道是离域的）呢？有点跟绕口令似的，呵呵 所得轨道图如下：（试了半天图没贴过来，汗） |
2楼2008-10-15 09:52:12
spkeey
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