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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » [求助] NBO 轨道和 MO轨道的区别
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spkeey

金虫 (正式写手)

[交流] [求助] NBO 轨道和 MO轨道的区别

我用
1。#p HF/6-31G pop=(NBORead,SaveNBOs,SaveNLMOs)
2。#p HF/6-31G pop=NBORead
3。#p HF/6-31G pop=(NBORead,SaveMixed)
4。#p HF/6-31G pop=(full,SaveMixed)
5。#p HF/6-31G sp
==========================
1。生成的chk文件，在gauss view 中看到的MO轨道分别是什么轨道？
2。SaveMixed和SaveNBOs,SaveNLMOs连用有什么区别？
3。NBO 和 NLMO 与 MO 的关系？
4。我自己认为SaveNBOs后的gauss view中的 MO 就是保存后覆盖的 NBO ，这个想法，是否正确？
5。不论NBO和SP save后的一致，但和不save的轨道不一致/，一定要save吗？save的到底是什么呢？
=====================
概念混乱，望大家按问题回答，答对奖励分数。清晰而具体的加分。
=====================
还问个问题，怎么把图像和 log中的NBO 轨道 的系数 联系起来？如果回答，我另外开帖送分？

[ Last edited by spkeey on 2008-10-14 at 21:40 ]
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SPKEEY
1楼2008-10-14 21:27:06
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xingkai-xingkai

木虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 5-3 18:07
轨道图应该是用可视化看到吧
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7楼2008-10-27 09:22:30
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 5-3 18:07
同样迷糊，期待高手给予解答

#################
lz可能已经看过help，我再重新贴一下手册中对lz提到的某几个关键词的说明：
SaveNBOs
Save natural bond orbitals in the checkpoint file (for later visualization).

SaveNLMOs
Save natural localized molecular orbitals in the checkpoint file (for later visualization).

SaveMixed
Save the NBOs for the occupied orbitals and the NLMOs for the unoccupied orbitals in the checkpoint file (for later visualization).

################
自己对SaveNBOs做了下测验（三重态的氧分子），发现两点不同：
1.加了SaveNBOs后，nbo的输出文件中在alpha电子和beta电子后面多了这么几句话：
alpha电子后面：
Sorting of NBOs:                           2    3    4    7    1    8    9    6    5   10
Reordering of NBOs for storage:     2    3    4    7    1    8    9    6    5   10
Labels of output orbitals:  CR  CR  LP  LP  BD  LP  LP  LP  LP  BD*

beta电子后面：
Sorting of NBOs:                           4    5    1    6    7    3    2   10    9    8
Reordering of NBOs for storage:     4    5    1    6    7    3    2   10    9    8
Labels of output orbitals:  CR  CR  BD  LP  LP  BD  BD  BD* BD* BD*
2.用两者的chk文件看最高占据单电子的MOs时发现所得轨道图并不相同，而输出文件中给出的轨道能是相同的，这是否是由于savenbos得到的是自然键轨道，是定域的，而没有save的chk文件得到的是分子轨道理论中所提到的那个分子轨道（该轨道是离域的）呢？有点跟绕口令似的，呵呵
所得轨道图如下：（试了半天图没贴过来，汗）
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2楼2008-10-15 09:52:12
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spkeey

金虫 (正式写手)
有人解释没有啊？？？？
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SPKEEY
3楼2008-10-17 11:45:59
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fineren

木虫 (正式写手)
顺路问一下，轨道图是怎么得到的？是不是必须保存NBO或NLMO，然后用gview打开？
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4楼2008-10-17 13:13:08
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sunlong650

木虫 (正式写手)

懒虫
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
看nbo 可以直接在out文件看，不用在guassview看也可以吧，看是什么化学键，和杂化类型，还有键长·····
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中华崛起
5楼2008-10-20 10:18:34
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yuan888

铜虫 (小有名气)
怎么没人回答呢，我也遇到同样的疑问
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6楼2008-10-27 09:11:46
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lxl8506

铜虫 (正式写手)
★ ★ ★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 5-3 18:07
1、在win版高斯的utilities里选择formchk功能，打开chk文件然后就可以转化成fch格式的forchk文件了；在linux版用命令：formchk  *.chk  *.fchk就可以转化成fchk格式的forchk文件。
2、Gaussview打开fchk文件，然后选择 Results/Surface, 在Cube Action弹出的对话框中选择New Cube,在弹出的对话框中选择分子轨道,点击OK，在Surface Action 弹出的对话框中选New Surface,选完后要等一会出现了分子轨道图。后面的自己再摸索摸索吧。
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8楼2008-10-27 10:24:42
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yuan888

铜虫 (小有名气)
lx8506你说的这些谁不知道啊，而且也用不着你这么麻烦 ，，你看好了人家问的什么问题再回答！！！！！！！！！！
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9楼2008-10-28 12:41:53
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yuan888

铜虫 (小有名气)
lx8506你说的这些谁不知道啊，而且也用不着你这么麻烦 ，，你看好了人家问的什么问题再回答！！！！！！！！！！
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10楼2008-10-28 12:47:13
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