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请求配体受体复合物药效团诱骗集验证ROC曲线值的问题?
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我构建完药效团(Receptor-Ligand pharmacophore)后,选取活性集和非活性集(诱骗集)进行验证,然后ROC曲线结果最高只有0.6,如何能达到0.7?(我用的软件是DS3.0)。 我做的此类抑制剂复合物现有解析出并带有抑制剂的晶体很少,做出的结果是 9 features match the receptor-ligand interactions: AADHHHHPR。活性集选择的是IC50小于10000nM,根据结构多样性挑选50个。非活性集选了其他不同的三种抑制剂,选了1000个,但IC50值没有要求。 现在我应该进行药效团修饰(具体怎么做?)还是重新选择诱骗集(应该依照什么选?),根据我们实验室现有的条件,没有办法更换其他类复合物,我很苦恼,希望得到有效的解答!谢谢! |
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