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肠道菌群高通量测序16S可变区选择讨论
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| 目前本人想做奶牛肠道菌群分析,需要做高通量测序,但是本人对这方面小白一枚,完全不懂。好像每个可变区有一定的选择性,不知各位大神能否告知详细各区选择特点。本人所研究的主要与革兰氏阴性菌有一定关系。 |
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beibeihu113
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LysMoon: 金币+3, 谢谢! 2016-03-07 15:46:35
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高通量测序V区的选择跟许多因素有关,如测序费用、测序质量、单V区、双V区,后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频,里面涉及到许多常用的知识,如测序区域的选择,你如果感兴趣,可以看一下。视频地址 http://www.tinygene.com/technical-support/video-data 你也可以搜 微基生物科技(上海)有限公司,在技术支持--视频资料里面,第三个视频就是关于可变区的选择。 微基生物科技(上海)有限公司 专门做微生物多样性分析的,已经检测动物肠道、人类肠道样本数万例,跟许多高校、科研院所、三甲医院都有合作 。 |

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beibeihu113
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高通量测序V区的选择跟许多因素有关,如测序费用、测序质量、单V区、双V区,后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频,里面涉及到许多常用的知识,如测序区域的选择,你如果感兴趣,可以看一下。
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