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LysMoon

新虫 (初入文坛)

[交流] 肠道菌群高通量测序16S可变区选择讨论

目前本人想做奶牛肠道菌群分析,需要做高通量测序,但是本人对这方面小白一枚,完全不懂。好像每个可变区有一定的选择性,不知各位大神能否告知详细各区选择特点。本人所研究的主要与革兰氏阴性菌有一定关系。
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
LysMoon: 金币+3, 谢谢! 2016-03-07 15:46:35
高通量测序V区的选择跟许多因素有关,如测序费用、测序质量、单V区、双V区,后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频,里面涉及到许多常用的知识,如测序区域的选择,你如果感兴趣,可以看一下。

视频地址   http://www.tinygene.com/technical-support/video-data
你也可以搜 微基生物科技(上海)有限公司,在技术支持--视频资料里面,第三个视频就是关于可变区的选择。

微基生物科技(上海)有限公司 专门做微生物多样性分析的,已经检测动物肠道、人类肠道样本数万例,跟许多高校、科研院所、三甲医院都有合作
专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
2楼2016-03-07 09:56:46
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静雯

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by beibeihu113 at 2016-03-07 09:56:46
高通量测序V区的选择跟许多因素有关,如测序费用、测序质量、单V区、双V区,后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频,里面涉及到许多常用的知识,如测序区域的选择,你如果感兴趣,可 ...

如果是小鼠或大鼠的肠道内容物 取肠道的哪部分呢?空肠、回场、盲肠、结肠?还是整个肠道全取呢?
3楼2016-03-08 21:11:36
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 静雯 at 2016-03-08 21:11:36
如果是小鼠或大鼠的肠道内容物 取肠道的哪部分呢?空肠、回场、盲肠、结肠?还是整个肠道全取呢?...

至于取肠道的哪一部分,这个得看你自己的研究,看看你是研究的哪一部位。不同的研究,取样的部位不同。
专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
4楼2016-03-09 09:48:00
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fanfan9056

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你现在肠道微生物实验开展了吗?
5楼2016-08-12 11:33:48
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LysMoon

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by fanfan9056 at 2016-08-12 11:33:48
你现在肠道微生物实验开展了吗?

没有

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6楼2016-08-13 13:38:29
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