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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 肠道菌群高通量测序16S可变区选择讨论
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LysMoon

新虫 (初入文坛)

[交流] 肠道菌群高通量测序16S可变区选择讨论

目前本人想做奶牛肠道菌群分析，需要做高通量测序，但是本人对这方面小白一枚，完全不懂。好像每个可变区有一定的选择性，不知各位大神能否告知详细各区选择特点。本人所研究的主要与革兰氏阴性菌有一定关系。
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1楼 2016-03-05 16:54:36
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
LysMoon: 金币+3, 谢谢！ 2016-03-07 15:46:35
高通量测序V区的选择跟许多因素有关，如测序费用、测序质量、单V区、双V区，后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频，里面涉及到许多常用的知识，如测序区域的选择，你如果感兴趣，可以看一下。

视频地址   http://www.tinygene.com/technical-support/video-data
你也可以搜 微基生物科技（上海）有限公司，在技术支持--视频资料里面，第三个视频就是关于可变区的选择。

微基生物科技（上海）有限公司 专门做微生物多样性分析的，已经检测动物肠道、人类肠道样本数万例，跟许多高校、科研院所、三甲医院都有合作。
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专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
2楼2016-03-07 09:56:46
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静雯

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by beibeihu113 at 2016-03-07 09:56:46
高通量测序V区的选择跟许多因素有关，如测序费用、测序质量、单V区、双V区，后期对比所用的数据库等等。我们公司录制了关于高通量测序的一些视频，里面涉及到许多常用的知识，如测序区域的选择，你如果感兴趣，可 ...

如果是小鼠或大鼠的肠道内容物 取肠道的哪部分呢？空肠、回场、盲肠、结肠？还是整个肠道全取呢？
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3楼2016-03-08 21:11:36
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beibeihu113

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 静雯 at 2016-03-08 21:11:36
如果是小鼠或大鼠的肠道内容物 取肠道的哪部分呢？空肠、回场、盲肠、结肠？还是整个肠道全取呢？...

至于取肠道的哪一部分，这个得看你自己的研究，看看你是研究的哪一部位。不同的研究，取样的部位不同。
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专注微生物生态学研究 QQ2758452825 微基生物 400-660-9270
4楼2016-03-09 09:48:00
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fanfan9056

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你现在肠道微生物实验开展了吗？
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5楼2016-08-12 11:33:48
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LysMoon

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by fanfan9056 at 2016-08-12 11:33:48
你现在肠道微生物实验开展了吗？

没有

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6楼2016-08-13 13:38:29
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