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上官abc

金虫 (正式写手)

王下七武海

[交流] 菌液PCR有条带,质粒双酶切只有一条带,是怎么回事?急!

RACE PCR后经过一系列步骤,到菌液PCR时有目的条带,但很浅。
然后大量摇菌并提取质粒进行双酶切,发现只有一条带,貌似这条带就是载体PMD18-T。上一次没进行双酶切就送质粒去测序,结果测序公司发回报告说送去的是空载体。这次看来也是没连上,实在不知道为何老是连不上PMD18-T,请各位大侠指点迷津,谢谢!  我用的是宝生物的RACE和PMD18-T试剂盒,菌液PCR目的片段470bp左右,3'RACE得到的目的片段在2000bp左右。
菌液PCR有条带,质粒双酶切只有一条带,是怎么回事?急!
双酶切电泳图


菌液PCR有条带,质粒双酶切只有一条带,是怎么回事?急!-1
菌液PCR电泳图
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上官abc

金虫 (正式写手)

王下七武海

引用回帖:
4楼: Originally posted by jackyoung at 2016-03-05 09:02:20
应该是假阳性,PCR体系或所用菌液中有污染,毕竟T载连这么大的片段那个效率是很低的。另外,3'RACE别没事就搞那么大片段,这有点儿扯了。这种体系中亲测还是500-1000比较靠谱,要不那个成功率太低。
...

用宝生物试剂盒得到的RACE产物缺少A尾,得用加A试剂盒加上A尾才能连T。
10楼2016-03-07 17:37:43
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匿名

用户注销 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
2楼2016-03-04 21:28:56
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yvonne9044

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
菌液pcr很浅就是假阳性,连T一般都没问题,你再试试是不是药品问题

发自小木虫Android客户端
3楼2016-03-05 00:47:59
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jackyoung

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
应该是假阳性,PCR体系或所用菌液中有污染,毕竟T载连这么大的片段那个效率是很低的。另外,3'RACE别没事就搞那么大片段,这有点儿扯了。这种体系中亲测还是500-1000比较靠谱,要不那个成功率太低。

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2016-03-05 09:02:20
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