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守着风儿木虫 (著名写手)
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[求助]
求帮忙修一下squeeze过后的分子式~~~~~~ 已有1人参与
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squeeze掉了溶剂分子，已经没有AB错误啦，根据热重和元素分析算出来了溶剂分子，但是不知道怎样在cif里面加上这些squeeze掉的分子，在ins里面改，xl一下又变回原形了，所以请帮忙修一下。 Squeeze掉的是3.5个DMF，1个抗衡的二甲胺阳离子和9.5个水分子[ Last edited by linhua0402313 on 2016-2-29 at 15:59 ] |
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2016-02-29 15:54:25, 3.72 M
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【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
| Add calculated solvent molecules to the SFAC and UNIT list of f10p.ins and do final XL. In this case, 6 molecules of CH2Cl2 were found so there are 6C, 12H and 12Cl. Open f10p.ins, add 6C, 12H, 12Cl to current list of SFAC and UNIT. Save the file f10p.ins and quit. Run final XL. You will see the message of **Cell content does not agree. Ignore this because disordered solvent molecules were not located… their electron density has been “squeezed” into the rest of the molecule. |
2楼2016-02-29 20:19:53
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3楼2016-02-29 20:21:10
xwnail2003
禁虫 (著名写手)
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4楼2016-03-01 08:29:47
守着风儿
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啊谢谢，我把unit里面的改过来了，但是重新XL之后多出来几个a类错误，这几个可以忽略吗？不能忽略应该怎么办呢？另外，我的溶剂分子是通过TGA算的，结果和元素分析吻合，这样可以确认是对的吗？还是需要再看别的参数呢？ CHEMW03_ALERT_2_A ALERT: The ratio of given/expected molecular weight as calculated from the _atom_site* data lies outside the range 0.90 <> 1.10 From the CIF: _cell_formula_units_Z 8 From the CIF: _chemical_formula_weight 4244.17 TEST: Calculate formula weight from _atom_site_* atom mass num sum C 12.01 52.00 624.57 H 1.01 32.00 32.26 Cu 63.55 2.00 127.09 N 14.01 8.00 112.06 O 16.00 40.00 639.96 P 30.97 1.00 30.97 W 183.85 12.00 2206.20 Calculated formula weight 3773.11 PLAT043_ALERT_1_A Calculated and Reported Mol. Weight Differ by .. 471.16 Check PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure ! Info |
5楼2016-03-01 10:47:49
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