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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求帮忙修一下squeeze过后的分子式~~~~~~
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守着风儿

木虫 (著名写手)

[求助] 求帮忙修一下squeeze过后的分子式~~~~~~ 已有1人参与

squeeze掉了溶剂分子，已经没有AB错误啦，根据热重和元素分析算出来了溶剂分子，但是不知道怎样在cif里面加上这些squeeze掉的分子，在ins里面改，xl一下又变回原形了，所以请帮忙修一下。
Squeeze掉的是3.5个DMF，1个抗衡的二甲胺阳离子和9.5个水分子[ Last edited by linhua0402313 on 2016-2-29 at 15:59 ]
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    • 2016-02-29 15:54:25, 3.72 M

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1楼 2016-02-29 15:56:08
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Add calculated solvent molecules to the SFAC and UNIT list of f10p.ins and do final XL. In this case, 6 molecules of CH2Cl2 were found so there are 6C, 12H and 12Cl. Open f10p.ins, add 6C, 12H, 12Cl to current list of SFAC and UNIT. Save the file f10p.ins and quit. Run final XL. You will see the message of **Cell content does not agree. Ignore this because disordered solvent molecules were not located… their electron density has been “squeezed” into the rest of the molecule.
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
2楼2016-02-29 20:19:53
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
还有这句话
The most important thing is that the number of disordered solvent molecules should have some chemical sense with regarding to the symmetry and Z value of the crystal.

建议你好好检查TG的结果，最好在结合一下元素分析

祝好运
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
3楼2016-02-29 20:21:10
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
4楼2016-03-01 08:29:47
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守着风儿

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2016-02-29 20:21:10
还有这句话
The most important thing is that the number of disordered solvent molecules should have some chemical sense with regarding to the symmetry and Z value of the crystal.

建议你好好检查TG的 ...

啊谢谢，我把unit里面的改过来了，但是重新XL之后多出来几个a类错误，这几个可以忽略吗？不能忽略应该怎么办呢？另外，我的溶剂分子是通过TGA算的，结果和元素分析吻合，这样可以确认是对的吗？还是需要再看别的参数呢？

CHEMW03_ALERT_2_A ALERT: The ratio of given/expected molecular weight as
            calculated from the _atom_site* data lies outside
            the range 0.90 <> 1.10
           From the CIF: _cell_formula_units_Z                    8
           From the CIF: _chemical_formula_weight          4244.17
           TEST: Calculate formula weight from _atom_site_*
           atom     mass    num     sum
           C        12.01   52.00  624.57
           H         1.01   32.00   32.26
           Cu       63.55    2.00  127.09
           N        14.01    8.00  112.06
           O        16.00   40.00  639.96
           P        30.97    1.00   30.97
           W       183.85   12.00 2206.20
           Calculated formula weight             3773.11
PLAT043_ALERT_1_A Calculated and Reported Mol. Weight Differ by ..     471.16 Check
PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure        ! Info
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5楼2016-03-01 10:47:49
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游荡生活！

禁虫 (正式写手)
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红舟流星: 金币-20, 屏蔽内容, 违规存档, 广告 2016-06-17 23:07:47
红舟流星: 金币-20, 其他未说明的违规行为，版主可以酌情给予1-10个金币的处罚。情节特别严重的可以给予10-20个金币的处罚，并记录违规存档。 2016-06-17 23:07:54
本帖内容被屏蔽
6楼2016-03-01 13:15:51
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HMYZ-HUST


发自小木虫Android客户端
7楼2016-03-01 13:20:53
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