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序列比对之后如何建系统发生树?
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qaz199018
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性别: GG
专业: 免疫生物学
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]
序列比对之后如何建系统发生树?
已有2人参与
小弟新手,多序列比对之后要把所用的序列截成同样长的片段嘛?怎么用DNAMAN比对之后发现不能编辑啊……
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1楼
2016-02-28 21:51:26
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李婷遥
新虫
(初入文坛)
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注册: 2013-07-07
性别:
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专业: 生理生态学
我只会绘制乳酸菌的,酵母菌的不会,你会吗
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只要有半分之一的希望,就要付出百分之百的努力
2楼
2016-03-21 10:48:31
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xiadongliang
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性别: GG
专业: 环境微生物学
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★ ★
qaz199018: 金币+2,
★★★
很有帮助, 谢谢!
2016-03-22 14:44:51
用mega软件进行系统树构建吧,DNAman不是专门用来建树的。
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3楼
2016-03-21 12:16:24
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gnot_nail
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虫号: 3501670
注册: 2014-10-27
专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★
qaz199018: 金币+3,
★★★★★
最佳答案, 谢谢!
2016-03-22 14:44:38
用MEGA,不需要截成同样大小,差不多就行,但是大小相差过大会提示你是否继续建树,继续的话仍然可以但是会很大程度影响建树结果准确性,相差超过限定的值时好像就无法建了。一般建树选的都是同源蛋白,长度不会差太离谱,一般问题都不大。
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4楼
2016-03-21 23:19:57
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