1、用于创建protomol文件的配体分子是PDB蛋白质的原始配体还是想要用于进行对接的化合物分子？2、对接前，对接的化合物分子是否需要事先进行Tripo能量最小化处理？3、对接前，蛋白质准备时...

大家好，最近在做sybyl。但是之前一直用的sybyl-x2.0版本，现在需要计算RMSD值，想寻求一份sybyl-x1.1，或者有谁知道如何用sybyl-x2.0计算RMSD值，谢谢大家。

0.583RelativeContributionsRun1#Norm.Coeff.Fraction-1COMFA7(343vars)(Steric)2.2110.4672COMFA7(343vars)(Electrostatic)2.5230.533Run2#Norm.Coeff.Fraction-1COMFA7(343vars)(Steric)2...

用sybylx2.0做分子对接，怎么实现1个蛋白分子同时与多个化合物分子对接（这个分子库怎么构建的）。之前弄过，现在一直出不来对接不了。谢谢

我现在刚开始学用SYBYL-X2.0做3D-QSAR，现在遇到的问题是，打开SYBYL以后commandconsole框里会提示：WARNING:...InvalidSubstructureName-<1.SubstructurewillbenamedUNNAMED...

求助各位，本人新手一枚，安装了SYBYL-X2.00.12055-Windows版本，但是使用不了MDE窗口上的Data-CalculateProperties功能（没看到...1.如果是安装的版本有问题，请大神赐我一个可以用的版本。...

刚才找了，好多衔接都失效了，无论什么方式都行，多谢了。q54真的万分感谢[Lasteditedbyll9999on2017-1-21at21:51]

9同一个化合物表单中分子，原先利用X2.0和现在用X2.1.1与同一个蛋白docking的结果不同，排序有较大差距。...13SYBYL中Similarity与RMSD值的异同1)Surflex-dock对接中设置模板分子后，对接结果...

X2.0来计算分子的principalmomentsofinertia（分子主惯性矩），按照图中的教程，打开sybyl-Xcommandline输入命令ORIENTBEST_VIEWmol_expr，回车，然后一直显示moleculeaream1isempty，...

各位老师，我是SYBYL学习新手，学习TopomerCoMFA的过程中遇到问题：1、打开我的小分子数据集（hits格式文件）后，电脑显示...PS：我用的是SYBYL-X2.0万分焦急，如若能帮助解决问题，必当重谢！

第一次做分子拼接，大分子蛋白准备好后，在LigandSource界面开始出现问题，选择小分子后，如果点prepare选择docking，准备后地址框里就变成了空白...截图放上:shuai1.jpgD2.jpgD3.jpgD4.jpg

最近新装了win764位旗舰版系统，但是在sybyl-x1.1安装后，发现出现启动不了的情况，鼠标双击图标后毫无反应。...另外sybyl-x2.0情况类似，只是点击快捷方式就可启动，但中间仍需等待两分钟。...

dock.exe-multiproc11-sybyl_ref3q6x_ligand.mol2-multistart0-grid_bloat6-maxconfs20-maxrot100-self_score-ring-rigid+soft_box+...0-protomol.mol23q6x_H4.mol2DockingRun_003HOSTNAME:...

以前用sybyl-X2.0进行randomsearch后生成一个.tbl文件，然后可以...以为是软件问题，SYBYL-X-1.1.083，SYBYL-X-2.0.0.11273，SYBYL-X2.0.0.12055都尝试安装，结果还是一样。希望大家帮帮我！

本人是新手，准备做分子对接，有两个问题不明白，想请教一下高手：1.sybyl-x2.0中的surflex-dock和flexi-dock之间有什么区别？2.若是两个小分子之间的对接，sybyl-x2.0能做吗？想用蛋白质与...

恳请大侠们，特别是哈尔滨工业大学的大哥大姐能帮忙下载共享一下Tripos.SYBYL-X-2.0.0.11273.LINUX.x86-RECOiL，这个资源在哈尔滨工业大学的FTP上，我这里下载经常断线，而且速度才不到1K...

RECOiL.zip几经周折与奋战，终于将sybyl-2.0个...另外，请高手提供2.0版本对应的Prodat和OrchestrarDatabases的下载？'......

想尝试一下再Linux下用Sybyl-X，1.X或者2.0都行，32位，Linux版的。论坛里的资源都失效了。电驴下载了很久也没有多少进展。哪位有可以分享一下吗。不胜感激！如不愿意公开分享，发个链接到'...

有几个问题想请教一些：（1）在Sybyl8.0里如何画配位键，如果不能画，用什么软件可以替代。（2）优化金属粒子配合物用什么立常希望各位高手指点。[Lasteditedbyx-coolon2012-5-21at18:05]

另：win系统下，sybyl-x1.3和2.0，在载入蛋白质，描绘表面时就会自动退出再重启，win2003下会反应内存不能read，win7下直接就退出再重启了。郁闷啊啊啊啊啊啊！求指导啊！

无论是sybyl-x1.3还是sybyl-x2.0，在打开一个4M的蛋白质并进行视图设置，表面描绘的时候，基本上都进行不下去，全部都是跳出再重启。郁闷啊，系统是win7-64旗舰版，i7的cpu，8g内存，6990m...

Win732位操作系统，安装坛子上“[资源]顺民意，重新上传SYBYL-X-2.0.0.11273-Windows(1234)(模拟EPI+1)(+22.4)(评阅+10)”blue_cat给的SYBYL-X-2.0，安装成功。但本人菜鸟，运行docking的...

昨天下了一下sybyl-x的视频教学1-8中的第一部分，但下到99.9%后就下不动了。有谁可以把第一部分传一个给我呀，谢谢！'huangtian205163.com'

昨天下了载了'http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3688206&fpage=1'里的sybyl-x-2.0.0。但里面的license过期了，现在程序运行不了，哪位大侠能传一个给我啊，不胜感激。

最近老师给装了个SYBYL-X1.3，让熟悉一下，准备做药物的构效关系，我想对SYBYL这个软件有个比较系统的了解，查网发现我至今还不太明白究竟SYBYL-X1.3是干什么的，怎么还有SYBYL7.0/SYBYL7.3...