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分类 共搜索到 172 个相关话题(最多显示前5000个) 作者 最后发表
化工设备 选对液相色谱:从灵敏度、联用技术到复杂样品解析力
图3.44批样品中6个成分的opls-da得分图(图源:natprodresdev,2025,doi:10.16333/j.1001-6880.2025.11.005)结果显示,采用uplc技术可在10分钟内完成香橼中新西兰牡荆苷、柚皮苷等6种成分的...
ChemBeanGo 2025-12-05 04:14
分子模拟 用lammps计算吸附时遇到bond missing
kcal/mol→eV)1opls-0.0000100.0000000.0129990.000000#原系数×0.0433644352opls0.056479-0.0086750.0086750.0000003opls-0.0000050.000000-0.0097680.0000004opls0.0650470.2385040....
Yuki——12345 2025-11-14 02:05
文献求助 论文求助
FTIR)andFourierTransformNear–Infrared(FT-NIR)SpectroscopieswithOrthogonalPartialLeastSquares–DiscriminantAnalysis(OPLS-DA)AnalyticalLetters2025showlessReceived04Oct2024,...
hwqiu 2025-04-23 01:07
硕博家园 三维荧光分析
红外,高光谱使用PLS-DA,Knn,RF,PCA,N-PLS-DA,OPLS-DA,SIMCA,SVM对光谱数据进行分析达到分类的效果平行因子bug解答三维荧光测量解答使用多变量回归进行量化,比如农药含量某鱼:爱科研...
爱科研的长毛兔 2024-10-22 05:46
分子模拟 求助gaussian输入文件如何设置单原子电荷
计算咪唑基离子液体的时候,用gaussian几何优化之后,得到的charge和opls-aa力场的电荷很不相同,gaussian好像用的是amber力场,请问如何在计算前设置单个原子的电荷smutaooxox6085
我想上岸gog 2024-05-13 08:47
分子模拟 gromas tip4p 水模型计算报错
大家好我正在学习gromacs,尝试用tip4p跑216个水分子的动力学计算我用软件自带的tip4p.gro作用输入文件,然后运行gmxpdb2gmx-ftip4p.gro之后在交互界面中选择15opls-aa以及1tip4p,得到conf....
luqing6879 2024-01-16 07:51
文献求助 外文文献求助
JulienBoccard,DouglasN.RutledgeAconsensusorthogonalpartialleastsquaresdiscriminantanalysis(OPLS-DA)strategyformultiblockOmicsdatafusionAnalyticaChimicaActaMarch2013Volume769,26...
szy85 2024-01-16 03:35
医学 OPLS-DA分不开,但是可以找出差异变量正常吗
我的组学数据可以通过P小于0.05和VIP大于1找到显著差异变量,但是OPLSDA图就分不开两组东西,请问这是合理的吗?或者有什么可以检查的点?目前检查了原始数据都是没有问题的。
coconutyz 2023-12-05 10:19
生物科学 代谢组学
OPLS-DA模型过拟合,可以只用单变量统计(p和FC)筛差异物质吗?gyesang
山青鱼目 2023-09-12 03:23
食品 差异代谢物的筛选
我已经使用simca做了OPLS-DA得到了VIP值,还需要得到P值才能筛选差异代谢物。由于我的simca版本老旧,并不能进行studentst检验,所以我想要使用excel或者SPSS来做t检验。我在查阅教程时发现...
袁白熊 2022-10-18 08:20
分子模拟 分子动力学模拟及其LAMMPS实现
(课程尚未完成,持续更新中)(三万字超长文预警)前言1.分子动力学基础1.1原理.1.2势能1.3温度、压强2.linux系统常见命令和操作3.lammps介绍和并行版安装(linux版)4.lammps模拟基本流程...
luyaobao 2022-05-22 06:58
药学 基于GC-MS的荆芥和荆芥穗饮片挥发油中化学成分特征分析
OPLS-DA结果结合t检验共筛选出薄荷酮、异胡薄荷酮、β-石竹烯、柠檬烯、β-蒎烯、胡薄荷酮、香芹醇、顺-p-2,8-薄荷二烯醇、1-辛烯-3-醇、4-异丙烯基甲苯10种引起两种饮片差异的主要代谢标志...
CNKI-Fjj 2022-04-22 01:42
硕博家园 SIMCA的OPLS-DA得分图怎么看?
请问各位虫友,SIMCA的OPLS-DA得分图应该怎么看?做出来的图横纵坐标都是1.00139*t[1]这样的形式,这代表是什么意思呢?我看别人的PCA分析和OPLS-DA分析横纵坐标好像都是以PC1、PC2两个主...
邀花1107 2021-12-15 03:06
绿色求助(高悬赏) 文献
SitongYe&HongmeiLuDeterminationofFattyAcidsinRiceOilbyGasChromatography–MassSpectrometry(GC–MS)...DA)AnalyticalLetters20211960361...
各个风度 2021-08-31 10:22
版块工场 想问问各位大神,在使用SIMCA作PCA图的时候,为什么删除异常点...
还有在做PCA转OPLS图的时候,出现的是柱形图而不是散点图,类似下图那种。
沉陆er 2021-08-04 03:34
分子模拟 编译user-intel包时出错
opls_intel.cppdoesnotexistsrc/fix_nve_asphere_intel.cppdoesnotexistsrc/improper_cvff_intel.cppdoesnotexistsrc/improper_harmonic_intel.cppdoesnotexistsrc/pair_airebo_intel....
nansh13 2021-07-10 03:15
药学 求助论坛帖子SIMCA官方的NMR代谢组学教程中的数据文件NMR_...
求助论坛帖中的数据文件NMR_METABOLOMICS.xls,原帖附件已经无法下载了论坛原帖'http://muchong.com/html/201706/7903363.html'分享一个SIMCA官方的NMR...包括OPLS-DA的操作,怎么画S-plot。
bhbnm 2021-03-23 08:12
分子模拟 MS建立的模型如何转化为除cvff力场以外的LAMMPS data文件?
导出car文件后使用lammps中的msi2lmp工具转化为data文件,试了几个力场文件,好像只有用cvff转换的data文件中有数据(但有缺失),其他的诸如opls转的data文件键角什么的都是0。但是我看到...
panyuk 2020-11-11 05:33
分子生物 【代谢组学】代谢组学与其他组学数据的整合
2.选择适合高维数据的多元预测模型(如PLS、OPLS-DA或lasso)。在后续步骤中使用此模型。3.应用(嵌套)交叉验证优化模型参数并评估预测性能,或使用外部测试集评估预测性能。在分类的情况...
remax520 2020-06-15 08:16
文献求助 Identifying Cranberry Juice Consumers with Predictive OPLS-...
ZhaoS1,LiuH2,SuZ3,KhooC2,GuLIdentifyingCranberryJuiceConsumerswithPredictiveOPLS-DAModelsofPlasmaMetabolomeandValidationofCranberryJuiceIntakeBiomarkersinaDouble-Blinded,...
gnayye 2020-04-15 01:23
药学 simca41.1软件中opls-da分析的vip图具体怎么操作啊,急求
simca41.1软件中opls-da分析的vip图具体怎么操作啊,急求详细教程,我的那个vippredictive图标为啥一直是灰色的呢?
114508052 2020-04-14 07:06
微生物 生信 请教 代谢物与样本关联性分析用RDA还是OPLS合适哈
请教下前辈们,处理数据,代谢物与样本关联性分析用RDA还是OPLS合适哈,看都有用的,原理明白,不知道两个各侧重什么
395146894 2020-02-19 02:26
学术会议 代谢组学及数据分析培训(2019.11.23-28)
PCA模型的建立和解读√操作练习:OPLS-DA模型的建立和解读√案例分析:应激过程中代谢通路的响应√PCA-class模型在分类判断中的应用√操作练习:PCA-Class模型的建立和解读√案例分析:样品...
royata 2019-10-25 02:56
药学 Simca中opls_da分析问题
在软件中找不到oplsda只能用pca分析主成分分析,问了论文中的作者也没有回应,麻烦给各位大神用过的给个指导,很急很急
Yang2222dan 2019-07-08 03:38
硕博家园 simca-p软件如何选择分析模型
求simca-p软件如何选择分析模型,如PCA-X,O2PLS-DA,OPLS-DA,PLS-DA?RX2值和Q2如何判定?
libodoc 2019-06-14 01:56