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袁白熊

新虫 (初入文坛)

[求助] 差异代谢物的筛选 已有1人参与

我的实验设计是在黑蒜发酵过程中间隔固定时间取样,然后做代谢组筛选发酵过程中的差异代谢物。我已经使用simca做了OPLS-DA得到了VIP值,还需要得到P值才能筛选差异代谢物。由于我的simca版本老旧,并不能进行students t检验,所以我想要使用excel或者SPSS来做t检验。我在查阅教程时发现t检验是两组样本之间进行的,而我的样品依时间分为10组,OPLS-DA也是10组一起做的。现在我的疑问是t检验可以在10组之间做吗,如果不行的话该如何筛选差异代谢物呢?两两检验吗?如果是两两之间比较的话OPLS-DA是不是也需要在两两之间做呢?或者,如果您能提供simca 16就更好了
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gslzzhixin

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对于正态分布连续性变量组间比较,两组之间比较用one way Student t-test来计算p-value,三组及三组以上同时比较用one way ANOVA。
2楼2022-10-19 02:07:40
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屁?孩

新虫 (小有名气)

请问这个问题解决了没呢,也想知道如何解决这个问题

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3楼2023-01-09 12:11:59
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袁白熊

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 屁?孩 at 2023-01-09 12:11:59
请问这个问题解决了没呢,也想知道如何解决这个问题

我后来就是在两两之间筛选的

发自小木虫Android客户端
4楼2023-10-17 10:06:41
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