24小时热门版块排行榜    

查看: 2893  |  回复: 4

胡化静

木虫 (小有名气)

[求助] 上下游引物的,退火温度怎么设?已有2人参与

我的上下游引物的Tm相差20度,一个63.7,一个83.1,退火温度我设定的是62。P不出来,连引物二聚体都没有。有没有高手指点一下?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

啦啦啦
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫刘树青

木虫 (著名写手)

夜未眠

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
重新设计引物,相差这么大,特异性太差了,肯定P不出来。也可以让80的那个引物减少个数
世界上只有一种真正的英雄主义,那就是看清生活的真相之后,依然热爱生活。
2楼2013-12-15 20:18:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Dr.G

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-15 21:56:29
胡化静: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-12-16 09:21:51
你好,你用的DNA聚合酶的说明书上要求的最适退火温度是多少?(有的是Tm低1-2度,有的低5度等等)
1.引物设计的原则之一就是正反向引物的Tm值尽量一致;
2.P不出来常见原因:a.退火温度太高,引物与模板互补配对结合效率低或者不能结合;b.模板GC含量太高,变性时不易解链;c.模板浓度太低;d.模板降解了
3.62度的退火温度,Tm值是83的引物理论上可以和引物互补配对结合了。
建议:1.统计模板GC含量高不高;2.降低退火温度试一试(根据你用的聚合酶的说明来降低)
3楼2013-12-15 21:16:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胡化静

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Dr.G at 2013-12-15 21:16:28
你好,你用的DNA聚合酶的说明书上要求的最适退火温度是多少?(有的是Tm低1-2度,有的低5度等等)
1.引物设计的原则之一就是正反向引物的Tm值尽量一致;
2.P不出来常见原因:a.退火温度太高,引物与模板互补配对结 ...

有一个引物GC含量71%,但是我是加端的,加的片段GC含量就是高。
啦啦啦
4楼2013-12-16 09:28:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Dr.G

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 胡化静 at 2013-12-16 09:28:22
有一个引物GC含量71%,但是我是加端的,加的片段GC含量就是高。...

1.引物额外加端的序列不用参与引物Tm值的计算
2.模板的GC含量怎么样,有没有超过60%,如果超过60%就算比较高了,这个时候就不太好扩了,可以适量加入DMSO(二甲基亚砜)帮助解链
3.你的模板是基因组还是cDNA,模板有多长?
建议:1.把你的正反向引物的Tm值调到一致(加长Tm值低的引物长度,减短Tm高的引物长度);2.依照你使用的Taq酶的使用说明重新设置反应条件(退火温度和延生时间很关键)再试试;
祝你好运
5楼2013-12-17 19:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 胡化静 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我标书代码变了 +14 学员NHuqdk 2024-06-16 22/1100 2024-06-16 22:35 by 15603661789
[硕博家园] 硕博巨婴,也许才刚刚开始 +30 SNaiL1995 2024-06-12 74/3700 2024-06-16 17:08 by SNaiL1995
[找工作] 初始合伙人来啦!(生物试剂耗材标准品) +8 欢快的小科研人 2024-06-15 14/700 2024-06-16 16:00 by 欢快的小科研人
[论文投稿] 编辑是什么意思 15+3 s090604054 2024-06-15 3/150 2024-06-16 10:29 by bobvan
[论文投稿] 二审返修送审10天了,原来一审的3个审稿人只有2个接受了审稿,会邀请新审稿人么? 50+3 huanpo116 2024-06-15 5/250 2024-06-16 10:27 by bobvan
[基金申请] 博士后创新人才支持计划公示 +9 aishida144 2024-06-14 15/750 2024-06-16 09:52 by msjy
[基金申请] 博后面上今天有bug可以看到是否资助? +20 lyfbangong 2024-06-12 31/1550 2024-06-15 21:18 by since—2010
[考博] 上海交大招收材料化学方向科研助理/“申请考核”博士(请勿回复帖子或站内投条) +3 灵梦and紫 2024-06-12 4/200 2024-06-15 20:58 by 1822836277
[食品] 食品博士导师 +6 小李醒yy 2024-06-11 9/450 2024-06-14 23:37 by 小李醒yy
[基金申请] 博士后基金需要结题吗? +8 zhouchuck 2024-06-13 8/400 2024-06-14 17:27 by liuyupu132
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +4 Lwenter 2024-06-14 4/200 2024-06-14 14:32 by ou0551
[考博] 申博找导师 +4 疏影横斜水清浅3 2024-06-13 6/300 2024-06-14 14:31 by zxl_1105
[论文投稿] ACS Nano投稿后分配到副编辑手里12天了,能确定送审了吗? +5 潇洒怡惜 2024-06-12 10/500 2024-06-14 09:56 by 潇洒怡惜
[论文投稿] 最近写了一篇控制优化领域的文章,可以投哪里啊?有没有水一些的期刊推荐 +7 香瓜木香 2024-06-12 13/650 2024-06-14 07:05 by 香瓜木香
[基金申请] 博士后面上项目状态还是专家评审吗 10+9 Thatcheremu 2024-06-13 55/2750 2024-06-13 21:23 by 乌合麒麟
[硕博家园] 科研求助 +5 杲www 2024-06-12 6/300 2024-06-13 16:16 by 姓李名明
[考博] 博导选择 +3 bing85977 2024-06-12 3/150 2024-06-13 15:34 by 我是邱尧
[论文投稿] with editor日期变更 +3 慎独的小花卷 2024-06-12 8/400 2024-06-13 11:00 by 慎独的小花卷
[基金申请] 博后特助这周出结果吗?往年都是啥时候啊? +13 jsqy 2024-06-12 17/850 2024-06-12 19:55 by Lynn212
[硕博家园] 求助 +6 LYWwrz 2024-06-09 9/450 2024-06-11 13:12 by powerhours
信息提示
请填处理意见