24小时热门版块排行榜    

查看: 5145  |  回复: 3

小虎6487

金虫 (小有名气)

[求助] PCR引物退火温度怎么计算?

最近做PCR设计了一对引物,引物序列为:
F:CGTGCCTCCTATCCACGATTCCG
R:ATTTTGCGTAATTGGGTTTGATT
  引物序列和模版完全配对的,可是实验的时候成功率很低,每次都只能扩增出来不多几个样本,引物合成报告单上正向引物的Tm值65.5度,反向引物53度,是不是因为两条引物的Tm值相差太大啊?已经尝试了好几个温度了还是扩增效率很低?
  求高手帮忙分析哪里出问题了,需要重新设计引物吗,有个同学说可以给反向引物的5'端增加几个碱基提高一下退火温度,这样做可以吗?每条引物的退火温度怎样单独计算啊?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

适者生存
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yimingwang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-08-10 14:20:13
小虎6487: 金币+5, 有帮助 2013-08-11 09:05:23
小虎6487: 金币+10, 有帮助 2013-08-12 18:17:21
Primer Tm Calculator在线使用。

http://www6.appliedbiosystems.com/support/techtools/calc/
Let'sdoit.
2楼2013-08-10 00:13:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dearwoniu

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小虎6487: 金币+5, 有帮助 2013-08-11 09:05:34
引物的计算方法有多种,根据其长度能够选择多种计算方法。你的引物两条引物的GC含量差异很大,必须要迁就反向引物,这样的退火温度不好设定。可以尝试给反向引物增加碱基以提高Tm值,将反向以引物的Tm提高到接近正向引物,退火温度在58-60左右再试试。
关于计算,可以借助设计惹软件。提供一文章做参考:解链温度( Tm) 不同预测方法的比较  张艳春,屈武斌,卢一鸣,周 扬,张成岗
3楼2013-08-11 08:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amareyue

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以在两者之间设多个温度梯度自己摸索一下最适合的温度,如果有温度非特异扩增不明显,就这个温度扩增然后切胶回收自己需要的带,如果都不怎么样,非特异扩增较明显的话,就重新设计引物吧
4楼2013-08-11 16:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小虎6487 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 2025年CSC联培申请-网申攻略 +4 shi123946 2024-11-06 4/200 2024-11-10 23:43 by 泡芙与咖啡
[论文投稿] Angew返修二审三周了,有多大概率拒稿 +9 gccalj 2024-11-06 9/450 2024-11-10 21:09 by sjlnts
[论文投稿] 二审审一年的佛系编辑 +6 thefoxrain 2024-11-09 10/500 2024-11-10 12:32 by liunahan
[硕博家园] 科研论文招人 +5 姜建伟 2024-11-07 9/450 2024-11-10 10:31 by m739182102
[论文投稿] 请问修改稿推迟了几个月,还有机会接收吗? 6+4 fc5878 2024-11-06 6/300 2024-11-10 09:27 by huixiong0627
[硕博家园] 奖学金评定太黑了 +17 超电正 2024-11-08 20/1000 2024-11-10 06:53 by nono2009
[基金申请] 华东理工大学10月29日有两名化学化工教授突发疾病去世, 56岁和60岁 +7 babu2015 2024-11-05 7/350 2024-11-09 17:47 by yangmengze
[公派出国] 申请阶段:CV该不该添加个人照片呢? +3 shi123946 2024-11-06 4/200 2024-11-09 16:48 by jiugai142
[考博] TADF方向25申博求收留 +5 儒雅ddd 2024-11-07 7/350 2024-11-09 11:33 by 姜建伟
[考博] 中南大学的博士好申请吗 +3 娜娜不是娜 2024-11-07 4/200 2024-11-08 18:54 by tomboliboo
[论文投稿] 请问一下大家关于有机膜用于水处理方面好投的期刊有哪些啊?孩子只求毕业 5+4 喝奶粉上火 2024-11-04 6/300 2024-11-08 16:55 by 13333105938
[有机交流] 均苯三甲酰胺溶解 20+3 xsxmc123 2024-11-07 3/150 2024-11-08 15:47 by czyzsu
[有机交流] 物质提纯 5+4 yolo678 2024-11-04 7/350 2024-11-08 10:58 by NLZeno
[基金申请] 国家自然青年基金可以给本科生发一次性劳务费吗 +7 Jiangnanyu1 2024-11-07 7/350 2024-11-08 09:31 by zhoulei7170
[论文投稿] 求助wos检索问题 100+4 阳阳阳888 2024-11-04 6/300 2024-11-08 09:08 by zhanggz
[考博] 请问各位科研助理 +5 江百川 2024-11-05 5/250 2024-11-08 09:02 by 闲云雅鹤
[有机交流] 乙醇遇到什么会变橙色 5+4 摸鱼的? 2024-11-06 6/300 2024-11-07 10:55 by 摸鱼的?
[论文投稿] IEEE Sensors Journal 5+3 阿龙呦long 2024-11-05 4/200 2024-11-07 10:37 by nono2009
[基金申请] 九部门发文:不得将专利授权数量作为人才评价、项目评审、职称评定、高校评价等的条件 +7 sjtu2012 2024-11-04 7/350 2024-11-05 21:54 by 剑客
[论文投稿] Require reviews completed状态大概一个多礼拜了正常吗 +3 Aries-FZU 2024-11-04 4/200 2024-11-04 22:26 by nono2009
信息提示
请填处理意见