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wanghd2826

铁虫 (小有名气)

[求助] 求高手指点RNA电泳图~~~~

第一次提RNA,用的是RNA iso plus,提取完后用普通1.2%的琼脂糖凝胶电泳跑的,电泳仪等用前均用DEPC水处理过,感觉过程中比较小心,但是结果还是不尽如人意,没有看到明显的18s 和28s,我是继续提纯呢,还是重提RNA呢,请各位提点意见~~谢谢
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): 同意 2011-08-20 22:32:10
重提吧,降解的很厉害呢。
风雪夜归人
2楼2011-08-20 09:07:11
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wanghd2826

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wqj1988926 at 2011-08-20 09:07:11:
重提吧,降解的很厉害呢。

同感啊 我觉的得重提了,RNA酶简直防不胜防啊。。。郁闷
3楼2011-08-20 09:19:10
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monkey491816

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-08-20 20:03:44
应该是你的RNA提取的不好,我之前提取RNA是电泳仪都没有什么处理跑出来的结果肯定是3条带的,胶你用0.8%-1%就可以啦。RNA降解很严重,且有蛋白污染。重新提取一次吧
4楼2011-08-20 15:49:36
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fangni

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

重新提吧,降解的比较厉害
5楼2011-08-20 21:05:43
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yixinyuan

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

还是得重提,肯定是又某个环节处理不到位,导致降解!
6楼2011-08-21 09:19:23
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friya0910

新虫 (正式写手)


dhd997(金币+1): 是 2011-08-28 09:45:30
引用回帖:
1楼: Originally posted by wanghd2826 at 2011-08-20 09:00:42:
第一次提RNA,用的是RNA iso plus,提取完后用普通1.2%的琼脂糖凝胶电泳跑的,电泳仪等用前均用DEPC水处理过,感觉过程中比较小心,但是结果还是不尽如人意,没有看到明显的18s 和28s,我是继续提纯呢,还是重提R ...

你提的是什么物种啊?我之前提的时候电泳仪还有电泳液就用以前做DNA的那些,效果也可以,所以我觉得还是操作的时候要小心点!
7楼2011-08-21 17:36:16
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wanghd2826

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-21 17:36:16:
你提的是什么物种啊?我之前提的时候电泳仪还有电泳液就用以前做DNA的那些,效果也可以,所以我觉得还是操作的时候要小心点!

我提的是昆虫的RNA,应该是过程中降解的太厉害了,但是又找不出到底什么原因,这几天又提了一次,还是不理想,主要是28s降解的太厉害,我把步骤贴出来希望大家看看有什么需要改进的地方。难不成是plus的问题。。。郁闷了。
1、虫体解剖+液氮研磨
2、研磨后转入1.5ml离心管+RNAiso plus 1.ml   充分混匀
3、室温静置5min,4度12000rpm离心5min
4、取上清进入新tube,加1/5体积的氯仿(200ul),震荡混匀
5、室温静置5min,4度12000rpm离心5min
6、取上清进入tube,加入等体积异丙醇,混匀。
7、室温静置10min,4度12000rpm离心10min
8、弃上清,向沉淀中加入1ml 75%冰冻乙醇清洗沉淀,4度12000rpm 离心10min
9、干燥沉淀 加入20ul DEPC水 取5ul进行电泳
8楼2011-08-26 08:56:27
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wanghd2826

铁虫 (小有名气)

另外,电泳用的是普通1%的琼脂糖凝胶,100V跑了40min吧(不会跑的过程中降解了吧)
9楼2011-08-26 09:02:47
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-08-28 09:45:46
wanghd2826(金币+10): 多谢西瓜~ 2011-08-29 09:37:47
引用回帖:
9楼: Originally posted by wanghd2826 at 2011-08-26 09:02:47:
另外,电泳用的是普通1%的琼脂糖凝胶,100V跑了40min吧(不会跑的过程中降解了吧)

40 min太久啦!跑胶过程降解是有可能的,我自己碰到过,当时测OD值看着挺好,未有降解的迹象,但是跑胶却拖尾。猜测是跑胶的问题,然后把缓冲液换成新的再跑,就得到很漂亮的图了。
跑胶的主要目的是看有没有降解和污染,只要看到5S和18S两条亮带没有拖尾就可以了。100V的话10到15分钟已经能区分开这两条带了,没必要跑太久,跑得越久越容易降解。
10楼2011-08-26 17:25:43
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