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happy-j

银虫 (小有名气)

[求助] WB结果不理想,呼唤帮助

WESTERN BLOT新手,重复了好几次都快郁闷了。。。
第一张图是β-actin的结果,第一次的时候结果挺好的,可是不知道为什么最近几次都是这样,出来的条带不清楚而且很细。。。而且还有说不清的杂点,呼唤高手指点~~~
具体实验操作:
      从Hep G2细胞中用碧云天的中性裂解液提的蛋白,用的abmart的一抗,稀释比例1:4000(试用装,说明书中说可用1:5000做),二抗稀释比例1:4000。
    上样蛋白100ug/20ul
     分离胶浓度12%,电泳条件:100V,150min; 转膜条件:250mA, 70min; 5%脱脂奶粉封闭1h, 一抗4度孵育过夜


第二张图是硫酸转移酶蛋白的结果,蛋白源及提取方法、电泳、转膜条件如上。抗体应该没有问题,稀释比例按照说明进行。这个为什么条带之间界限不清楚,而且为什么在条带交际处显色较深?




[ Last edited by happy-j on 2011-5-17 at 23:59 ]
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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
lstt09nk(金币+6): 感谢参与,欢迎常来 2011-05-19 13:37:07
happy-j(金币+1): 第一次发帖求助,非常感谢提供解决意见。 2011-05-19 20:29:08
引用回帖:
Originally posted by happy-j at 2011-05-17 23:58:07:
WESTERN BLOT新手,重复了好几次都快郁闷了。。。
第一张图是β-actin的结果,第一次的时候结果挺好的,可是不知道为什么最近几次都是这样,出来的条带不清楚而且很细。。。而且还有说不清的杂点,呼唤高手指点~ ...

内参的抗体是不是回收使用了?现在天气比较热,抗体容易失活效价变低,而且会产生杂点和高背景,建议不要回收。根据你内参的结果分析,主要原因就是荧光强度低,可提高抗体浓度,另外使用的发光液的敏感性很重要,好的ECL发光液可以节省抗体,降低背景值,Millipore的效果很不错(货号WBKLS0500)。
第二张图的结果,分析认为是上样量过大,100ug/泳道,已经过载,超过了凝胶的分辨率,相邻孔的蛋白已经连在一起了,效果和没有梳子是一样的。你可以看看100ug的上样量,考马斯亮蓝染色的结果是什么样的,再对比下20ug的上样量是什么效果。
3楼2011-05-19 09:41:41
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【答案】应助回帖

★ ★ ★
silicare(金币+3, EPI+1): 2011-05-20 17:03:51
引用回帖:
Originally posted by happy-j at 2011-05-19 20:39:40:
内参抗体没有回收使用,是新的抗体。用的发光液就是millipore,~~~~(>_<~~~~
之前做过上样量50ug/20ul的,但是结果跟上面的图差不多。。。然后有人建议可以调高上样量试试,所以...
再试一次,看会不 ...

先将SDS-PAGE跑的好看点(考马斯亮蓝染色),转膜后用立春红染色(可以将结果扫描存着),观察和考染的效果是否相当,最好把图贴上来会更直观些。
另外听楼主的意思,是没有做过预实验吧?抗体说明书给的建议稀释度都是一个范围,没有什么通用的稀释度的,不同的细胞(组织)相同蛋白的表达量也是不一样的,最好先做预实验,摸好合适的抗体浓度再做整张膜的正式实验。
附件里面有我做过实验的图片,可做为质控参考,

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7楼2011-05-19 21:47:44
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1. 调整蛋白浓度的时候一般选择所用的裂解液来调整,一来可以保证体系里面的离子强度保持不变,二来因为裂解液里面含有诸如EDTA等可以抑制蛋白酶活性,可以尽量避免蛋白被降解,如果没有裂解液也可以用PBS稀释,至于用水稀释的影响,自己没有做过对比,所以也不清楚
2. 裂解液大概成分就是:50 mmol/L Tris-HCl (pH 7.5), 150 mmol/L NaCl, 1% NP-40, 0.5% sodium deoxycholate, 0.1% SDS, 0.02% NaN3, 1 mmol/L PMSF, and 10 µmol/L leupeptin ,个人认为裂解液问题几率比较小,你也说了其他人用着比你做的好
3. 预实验一抗浓度设定:一般建议1:1000~1:2000我就做一个最高值,一个最低值。范围要是广,像Epitomics的抗体很多都是1:1000~1:10000,就会做3个,1:1000, 1:2000, 1:5000,另外需要强调的是我使用的曝光系统是X胶片感光,你的应该是机器曝光的吧?感觉机器曝光灵敏度会差很多,所以你的抗体浓度可能会比建议的浓度要高些才行(自己验证了才知道),梯度一般倍比,梯度差小了基本不会有变化的。
4.二抗第一次使用可以做个点膜的检测,按照倍比稀释后(TBST或PBST稀释),取1ul,点到NC膜上,干燥后直接加ECL曝光,选择一个浓度(荧光不能弱,也不要太强,判断得有一定经验),如图曝光30S,我会选择第3或者第4个浓度做为二抗使用浓度,以后不必摸索,直接使用。

9楼2011-05-21 09:14:42
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引用回帖:
Originally posted by happy-j at 2011-05-23 14:49:30:
不好意思,想再问你个问题。

请问,用BSA跟用脱脂牛奶封闭有很大的差别嘛?我做了个对比,但是不知道是我实验中其他环节出差别了呢还是确实是两个封闭液的差别,结果一个化学发光后效果很好,而另一个却没有 ...

封闭效果绝大多数情况下BSA会好些,封闭充分,背景相对干净,相对来说还可以起到提高检测敏灵敏度的效果。对于检测一些磷酸化和糖基化蛋白时则通常只选择BSA而不选择奶粉,否则会产生高背景。
你的是奶粉封闭结果没有条带?可能奶粉本身质量不行,或者奶粉溶入TBST后PH值降低太多,导致抗体失活了。一般情况不会出现一个有一个没有的情况,但不排除特例,我用过Bioworld公司的E-Cadherin抗体,使用奶粉检测背景高,分子量位置不对,投诉反馈后他们建议使用BSA封闭,果然效果很好,条带特异,分子量正确,没有背景,当时感觉很神奇....
胶可以提前配,放在自封袋中,加点去离子水保湿,4℃放置一周使用没有问题
二抗使用第三个梯度就可以
12楼2011-05-23 16:18:04
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引用回帖:
1599143楼: Originally posted by 乖乖宝贝 at 2013-02-21 20:58:23
你好!看了你的WB的实验,做得好漂亮哦。我想问问你哦,我最近做85KD的,买的是单抗CST的,结果做出来出现很多杂带,而且目标带与上下的杂带还会连在一起?做了几次每次都有杂带,估计是杂带避免不了,有什么办法使 ...

85KD的蛋白,胶浓度选择需要相对低些才能起到比较好的分离效果,建议分离胶浓度使用8%,如果原来用的就是8%,只能通过延长电泳时间提高分离效果了,另外可以调整抗体稀释度,把杂带消除是上策

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18楼2013-02-22 09:24:29
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引用回帖:
1599205楼: Originally posted by 乖乖宝贝 at 2013-02-22 12:22:12
一张是转膜后丽春红染膜,85KD的转膜应该可以了,但是封闭,抗体孵育曝光,很多杂带,表达也很高,最重要是目标条带和上下杂带连在一起了。一抗浓度稀释后,杂带仍然没有消失,现在就想办法把目标和杂带尽量分开些 ...

可以继续稀释抗体,不知道你的蛋白样品是什么,如果是纯蛋白还可以降低上样量,相信可以调整出单条带的结果
20楼2013-02-22 20:55:30
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