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MEGA5.1获取和构建系统发育树已有1人参与
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在分子生物学研究中，鉴定基因功能，避免不了与其他基因相比较，而利用蛋白序列构建系统发育树几乎是科研人员必备的基本技能，在此，我将向大家简单的描述一下构建系统发育树的流程。 1.首先，准备好要构建系统发育树的蛋白序列（一定要蛋白哦），然后把所有蛋白序列添加到fast格式的文件里，并且标清楚蛋白名称，在每个蛋白名称前面添加“>”；   2.准备好蛋白序列以后，打开mega5.1软件，点击align—edit/build alignment;  3.选择create a new alignment—protein；   4.选择data—open—retrieve sequences from file，现在准备好的fasta文件—打开   5.在此界面点击w—align protein—ok—ok，等待生成；   6.点击data—phylogenetic analysis—yes;  7.回到mega5.1主桌面，点击phylogeny-construct/test neighbor-joining tree—yes—compute，最终生成了系统发育树；   8.点击箭头位置选择进化树类型；  9.推荐生成的树，点击file—print打印为pdf版本，分辨率较高。 mega5.1免费获取地址，请关注微信公众号：懒胖子口袋，回复mega，获取下载链接。 |
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