24小时热门版块排行榜    

查看: 1318  |  回复: 5
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 13698610879 的 20 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

13698610879

新虫 (初入文坛)

[交流] 16srrna编码基因测序,一定要先克隆吗?

请问做16srrna编码基因鉴定时,一定要先克隆吗?我的菌是芽孢杆菌属,我直接用基因组测序,测序结果到ncbi比对,相似度全是100%,系统发育期怎么做啊!求大神解答

16srrna编码基因测序,一定要先克隆吗?


发自小木虫IOS客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linglan2612

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问这种情况下,在克隆哪些基因以进一步确定呢?
任务分解,做好计划,减少情绪对抗
5楼2019-09-20 16:19:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

13698610879

新虫 (初入文坛)

2楼2018-08-28 09:46:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yan104zhou

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小冀-: 金币+3, 鼓励回帖,有帮助 2019-01-05 18:51:28
1测序可以直接用菌液,也可以做出克隆,后者成功率更高2比对的时候可以限定种属,不然默认的话肯定比出来都是同一种属的相似度很高3芽孢杆菌类群亚种很多,只用16s很难准确区分,建议使用其它分子标记例如gyrB。

发自小木虫IOS客户端
3楼2018-11-20 13:42:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Wilen

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by 13698610879 at 2018-08-27 19:58:31
请问做16srrna编码基因鉴定时,一定要先克隆吗?我的菌是芽孢杆菌属,我直接用基因组测序,测序结果到ncbi比对,相似度全是100%,系统发育期怎么做啊!求大神解答

...

16srRNA一般不用NBCI比对的,用EzBioCloud比对,小于98.5%左右,则为疑似新种,再进行克隆测序。

发自小木虫Android客户端
4楼2019-01-05 15:48:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] EI学报,一审返修后,为啥不再送审,直接终审中? 10+4 qweasd12345 2024-05-27 6/300 2024-05-29 00:02 by dut_ameng
[文学芳草园] 对对子吧 +4 天若孤独 2024-05-22 5/250 2024-05-28 21:33 by 鱼翔浅底1
[论文投稿] Neurocomputing 外审结束 +7 mollyzhang_2003 2024-05-23 7/350 2024-05-28 13:53 by keyaner23
[电化学] 如何证明电极上镀上金了? 10+6 刻印时光 2024-05-22 11/550 2024-05-28 13:43 by 1061602127
[基金申请] 基金上会 +14 mrKiller 2024-05-25 20/1000 2024-05-28 10:11 by bnullh
[电化学] 如题SEI问题 5+3 ERRORe 2024-05-24 4/200 2024-05-28 10:01 by 姜尚真。
[考博] 24或25申博 +4 Jacob- 2024-05-22 7/350 2024-05-27 21:21 by 安塔瓦拉多
[基金申请] 面上基金会评专家,有回避机制吗? +4 huang1991js 2024-05-27 4/200 2024-05-27 19:08 by 星火12
[论文投稿] 通讯作者一定要放在署名的最后一个吗? 5+4 轨迹永远 2024-05-24 11/550 2024-05-27 19:02 by 张轻尘
[硕博家园] 我是很理想化一人 +6 hahamyid 2024-05-26 6/300 2024-05-27 18:13 by 大飞鱼鱼鱼
[基金申请] 科研之友阅读量近一周增加了200多。 +13 hdzw9071 2024-05-24 14/700 2024-05-27 17:29 by leeeru
[教师之家] 研究生在毕业答辩时挂了,遗憾 +7 spacr2022 2024-05-27 10/500 2024-05-27 12:45 by 懒羊羊2024
[基金申请] 感觉自然基金限制通过比例就是有点扯,学学B口,化学学部,不限制比例。 +10 wsjing 2024-05-26 14/700 2024-05-27 11:57 by kanmiaolucky
[硕博家园] 课题做到一半担心做不出来怎么办 +4 mkpooooo 2024-05-27 7/350 2024-05-27 11:56 by kanmiaolucky
[硕博家园] 周日 +6 1加油哦棒 2024-05-26 9/450 2024-05-27 10:30 by hahamyid
[硕博家园] 好奇博士每天学习的有效时间 +7 hahamyid 2024-05-25 7/350 2024-05-27 10:26 by mkpooooo
[硕博家园] 研0 +6 控制调剂yl 2024-05-25 11/550 2024-05-26 23:37 by sakuraai
[硕博家园] 2024博士招生 +3 big 混子 2024-05-26 3/150 2024-05-26 20:47 by 宁多缺毋滥
[有机交流] 苯磺酰氯与醇羟基反应 5+4 杨怼怼? 2024-05-22 12/600 2024-05-23 15:59 by mrzhl1986
[论文投稿] wiely投稿状态 10+3 甄小鱼 2024-05-23 3/150 2024-05-23 15:42 by 莱茵润色
信息提示
请填处理意见