24小时热门版块排行榜     石溪大学接受考研调剂申请>

【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
查看: 3131  |  回复: 5

kieael

新虫 (初入文坛)

[交流] autodock vina对接,氢键和疏水基团比较多的结合物打分却比那些少的结合物打分要低?已有3人参与

如图,第一个化合物打分最好的一个为 -7.1,第二个化合物打分最好的一个只有 -5.6,但是明显感觉第二个结合得比第一个要好,是怎么回事呢?

autodock vina对接,氢键和疏水基团比较多的结合物打分却比那些少的结合物打分要低?
DNMT1-triclosan-2D.png


autodock vina对接,氢键和疏水基团比较多的结合物打分却比那些少的结合物打分要低?-1
DNMT1-4-chlorocatechol-2D.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
一,打分不一定准。二,看起来相互作用多的不一定结合能好。

发自小木虫Android客户端
2楼2018-03-22 19:27:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kieael

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hclwonder at 2018-03-22 19:27:26
一,打分不一定准。二,看起来相互作用多的不一定结合能好。

相互作用多不应该就表示作用强烈,那这样结合得不应该就更牢固吗
3楼2018-03-22 23:11:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小米嘉

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
两个配体分子结构不同,无法一起比较吧。

发自小木虫Android客户端
……
4楼2018-03-23 07:31:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by kieael at 2018-03-22 23:11:42
相互作用多不应该就表示作用强烈,那这样结合得不应该就更牢固吗...

看得见的相互作用固然重要,看不见的相互作用有时也不容忽视。
同样是氢键,也有强弱之分。
除了加分的相互作用,还可能有减分的penalty,这个adt也是不会给你显示出来的。

发自小木虫Android客户端
5楼2018-03-23 09:44:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

拼命幸福寂静

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问一下 这个图是怎么做出来的呀

发自小木虫IOS客户端
6楼2022-03-28 22:18:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kieael 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] AC审稿 +3 马winner 2024-04-26 6/300 2024-04-27 09:08 by 马winner
[硕博家园] 聊天 +12 暮色恋伊人 2024-04-22 13/650 2024-04-27 08:40 by WASM
[教师之家] 大学直属学院卸任的副院长退休后还享受副处级的养老待遇吗? +3 苏东坡二世 2024-04-27 3/150 2024-04-27 08:03 by jurkat.1640
[论文投稿] with editor 两个月了,什么原因? +7 yiersan9 2024-04-24 16/800 2024-04-27 03:25 by yiersan9
[有机交流] 如何分离原料与产品 5+4 qwerasdf587 2024-04-24 13/650 2024-04-26 23:18 by 119966984
[论文投稿] 研二光催化6月底四篇二区什么水平 5+5 wjtab 2024-04-22 15/750 2024-04-26 19:25 by wjtab
[有机交流] 环肽的合成 +3 徐来不惊 2024-04-25 5/250 2024-04-26 16:56 by 徐来不惊
[考研] 学硕专硕 +5 小蜗牛* 2024-04-26 5/250 2024-04-26 16:43 by 鱼翔浅底1
[考研] 0854-0855调剂 +8 shangannum1 2024-04-21 12/600 2024-04-26 16:42 by yz仔
[考博] 申博求助 +4 dskabdh 2024-04-24 11/550 2024-04-26 15:54 by dskabdh
[考博] 25年博士申请 +6 Changzixuan 2024-04-25 11/550 2024-04-26 13:48 by 我属驴核动力驴
[硕博家园] 考研,求职还是考编? +15 xizj 2024-04-21 24/1200 2024-04-26 11:49 by Kan客
[考研] 381求调剂 +4 小刺猬987654321 2024-04-25 6/300 2024-04-26 10:57 by czl12138
[论文投稿] Chemical Engineering Journal投稿3周了,一直显示With editor状态。这是送审了吗? 10+4 yifeng11 2024-04-20 13/650 2024-04-26 09:48 by yifeng11
[基金申请] "颜宁:基础研究应顶天立地"能做到基础研究同时顶天立地的才是牛人 +5 zju2000 2024-04-24 5/250 2024-04-26 09:36 by LittleBush
[考博] 求博导 +6 好okjh 2024-04-21 10/500 2024-04-25 14:04 by 好okjh
[考博] 24年 申博 化学/材料 一作6篇sci +9 wangyp123 2024-04-23 11/550 2024-04-24 19:01 by bangbangbiu
[考博] 博士招生 +4 zx179 2024-04-24 7/350 2024-04-24 15:01 by H考研成功
[考博] 申博成果界定是根据Jcr分区还是中科院分区 +4 我属驴核动力驴 2024-04-22 5/250 2024-04-24 08:47 by 晓目崇
[论文投稿] 编辑是选国外的好还是国内的好。 +8 lizhengke06 2024-04-20 8/400 2024-04-22 08:58 by cuiyunjian
信息提示
请填处理意见