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最后发表
分子模拟
请问
hyperchem
如何对一个分子库进行分子叠合?
如何导入分子的database进行叠合呢?然后如何确定叠合后有多少个原子点?就是两个原子的距离大于0.5Å的话算两个原子点
whqllj
2014-06-27 08:17
无机/物化
如何画金属氧化物结构
请问如何在
hyperchem
或者其它软件画金属氧化物的结构,比如Al2O3,Bi2O3等,求赐教,不胜感激!
curry_ying
2014-06-27 07:16
量子化学
用
hyperchem
构象搜索问题。
用
hyperchem
构象搜索时,我看说明书是要先进行一个单点能计算,说是为了提供相应的分子信息。但是不知道用在哪里?还有最重要的问题是,在搜索之前要先命名二面角,但是如果想整个分子进行...
airqm7233528
2014-05-27 09:55
分子模拟
有没有人可以教我用
hyperchem
模拟冰晶?
参考文献用
hyperchem
软件制作冰面用于冰晶与蛋白作用的对接,只写了选取orthorhombic类型,单胞参量以及单胞中8个氧原子坐标,但是我是新手完全不会,有没有人可以指导一下?[eimg]2014/...
liliinjn
2014-05-16 07:06
量子化学
怎么把
hyperchem
建立的文件转化成高斯输入文件?
如题,怎么把
hyperchem
建立的文件转化成高斯输入文件?我想建一个金属氧化物晶体的输入文件,用chem3D建的时候老是提醒键数不对(氧最多只能连两个原子,多了连不上)。用
hyperchem
建的...
张鸿
2014-04-21 01:43
量子化学
怎样把MS中的结构导入到
hyperchem
怎样把MS中的结构导入到
hyperchem
,转化成什么结构?求指教
linbin1990
2014-04-18 01:53
量子化学
如何用
Hyperchem
模拟化学键断裂,如何设置键断裂的阙值?
我想模拟一种化合物受热分解的过程,设键长值大于初始键长值1.2倍时化学键断裂,请问在
Hyperchem
中如何设置?方便的话请您站短。谢谢各位大侠的鼎力相助。
huhonglin13
2014-04-08 11:57
分子模拟
hyperchem
复制图片
Hyperchem
中复制图片的时候图片都变成灰色了,怎么回事,完全看不见分子结构?
janet466158
2014-03-24 12:23
有机交流
老虫们来看看呗 关于
Hyperchem
7
刚刚接触这个软件画图优化结构的时候打开任务管理发现这个软件只能用一个核心怎么多核心一起处理啊还有可不可以GPU加速处理?老虫们来吃米拉新虫一只就有一粒米。
yaoye7758521
2014-03-11 02:15
量子化学
求助高斯计算后如何确定构象的blotzman 分布?
如题:我用
hyperchem
7.5做了构象搜索,然后低能量态的10个构象进行高斯优化。结果发现这些构象的自由能相差很小,都是0.005这个级别,不像文献报道上的0.几的差异。如果按网页给出的计算...
xwnail2003
2014-03-04 02:57
分子模拟
hyperchem
可以计算结合能吗?
今天在网上看到一篇论文,用
hyperchem
软件计算出了模板分子和功能单体之间的结合能,真的能够做到吗?是不是先在界面上分别将两个分子画下来,进行单点计算,然后把两个分子画在一起,再次...
姜志文
2014-02-23 01:04
量子化学
谈谈谐振频率校正因子
N/不输出
Hyperchem
文件323/温度。如果输入0则为默认的298.15K1/压力。如果输入0则为默认的1atm0.8905校正因子[回车][回车]然后立刻就看到了原始频率以及等同于scale=0.8905temperature...
sobereva
2014-01-19 04:25
计算模拟
hyperchem
使用。求助。
详细介绍用
hyperchem
程序计算一个分子的振动光谱的步骤.谢谢啦。
332965103
2014-01-10 03:10
量子化学
如何用
hyperchem
计算一个化合物分子的Ehomo和Elumo?
小弟因做QSAR需要计算分子Ehomo和Elumo,初学者,请问各位大哥怎么用
hyperchem
计算一个化合物分子的Ehomo和Elumo呢?求详细解答,不胜感激涕零!
可心jasmine
2013-12-27 02:07
分子模拟
请问
Hyperchem
能计算小分子物质的疏水性指数(PHI)吗?
各位前辈,请问
Hyperchem
能计算小分子物质的疏水性指数(PHI)吗?Hydrophobicityindex=Hydrophobicarea/Hydrophilicarea。我从文献上看到能够计算,如果可以计算,能帮忙指导下具体怎么...
wen530
2013-12-25 03:08
分子模拟
HyperChem
8.0.10
看到大家都在求助
HyperChem
,自己刚好找到最新版的
HyperChem
8.0.10,与大家分享一下。经测试winxp32位系统和win764位系统都可以使用。我也是刚接触到
HyperChem
,还不会使用,各位前辈也...
wfvvk
2013-12-24 12:39
分子模拟
请问
Hyperchem
能计算小分子物质的疏水性指数(PHI)吗
各位前辈,请问
Hyperchem
能计算小分子物质的疏水性指数(PHI)吗?Hydrophobicityindex=Hydrophobicarea/Hydrophilicarea。我从文献上看到能够计算,如果可以计算,能帮忙指导下具体怎么...
wen530
2013-12-20 09:36
分子模拟
问一个
Hyperchem
打开文件的问题
在用
Hyperchem
时,能打开的文件格式HIN、ENT(PDB)、SKC、MOL、ML2、CHM、ZMT。可是我要计算的文件时cif和pdb格式的,怎么把格式转换一下啊,而且
Hyperchem
需要的文件格式文件,都是在哪里...
笑`笑
2013-12-19 09:44
分析
转载:常用化学软件大全
HyperChem
等功能比PCSpartan更强,包括常用的几乎所有分子力学及半经验分子轨道方法及多种基集的从头计算等,并能计算振动光谱、电子光谱、分子动态学等,所得结果可以非常漂亮的三维...
费姚永芬
2013-12-12 06:41
计算模拟
关于QSAR建模过程中分子结构优化方面的疑问
等)画出分子结构图,然后利用
HyperChem
软件对分子结构优化,最后产生分子结构描述符。由于我才接触定量构效关系不久,许多地方不是太了解,前期主要是通过查阅文献,从文献中查找相关方法...
zhglxjt
2013-11-21 06:58
分子模拟
如何把.gjf文件转换为.mol文件
做MD计算,处理数据时用Chem3D打开时有太多的水分子看不清楚离子间成键情况,考虑把.gjf文件转换为.mol文件在
Hyperchem
中打开以便删去多余不成键的水分子,观察生成的离子簇情况...
向日葵2012
2013-11-21 06:40
分子模拟
如何构建冰晶的结构
我想用MS或者
Hyperchem
构建一个冰晶的模型(就像图里面的)请问具体怎么操作YI3~JF){25PP93OJXI1HRYA....
笑`笑
2013-11-20 09:02
计算模拟
如何用
Hyperchem
计算分子的直径
如题,我是
Hyperchem
新手,想计算一下分子的直径,如何算,谢谢
xhb2008
2013-11-07 10:52
量子化学
用
HyperChem
画过渡态时原子间的键长
用
HyperChem
画过渡态时需要调节原子间的键长,有谁知道那些常见的健长啊,比如C-O双键,单键什么的,求各位大神的指教啊
189眼泪知道
2013-10-21 12:14
量子化学
紧急求助,在线等答案,麻烦大家帮忙看一下电子云密度是否发生了...
我用
hyperchem
做的图,一个是苯的电子密度二维图,另一个是苯磺酸的电子密度二维图。由于磺酸根的吸电子效应,苯环上的电子向磺酸根方向移动,这个二维图可以说明问题吗,紧急求助哈,大家...
force-79469
2013-10-07 02:39
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