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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 资源 » PyMOL1.8.0.0 windows 64位版（应用最广泛的生物大分子显示软件）
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fishhope

铁杆木虫 (正式写手)

[资源] PyMOL1.8.0.0 windows 64位版（应用最广泛的生物大分子显示软件）

（1）Download and install Python 2.7.9 (and only python 2.7.9)。

（2）解压Pymol1.8.0.0_win_64.zip，执行install_pymol.bat，安装完后运行C:/Python27/pymol.exe即可。

更详细的安装方法见：
http://tubiana.me/how-to-install ... -windows-linux-mac/
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    • 2016-02-22 12:32:00, 17.96 M
  • 附件 2 : Pymol1.8.0.0_win_64.zip
    • 2016-02-22 12:37:59, 34.18 M

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1楼 2016-02-22 12:38:37
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fishhope

铁杆木虫 (正式写手)
fishhope: 回帖置顶 2016-04-08 14:19:39
引用回帖:
8楼: Originally posted by 雙子の殇 at 2016-03-01 21:37:02
楼主，我装上了软件可是打不开程序，打开是那种执行代码的界面

可能是没自动装好，手动安装即可，install_pymol.bat中的内容是：
echo Wheel installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install wheel

echo PWN Installation (for tkinter windows)
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

echo Numpy MKL Installtion
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

echo Pymol lib installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

echo PWN Graphic interface installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl

因此，打开一个命令行界面（按win+R输入cmd），然后执行：
C:\Python27\Scripts\pip.exe install wheel

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl
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19楼2016-03-16 21:15:53
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逗比哒蓝蓝

新虫 (初入文坛)

★ 一星级,一般

我刚刚尝试自己安装，发现需要注意以下几点应该就能成功：
1.目前从所给页面上下载下来的是1.8.2.0版本，不是1.8.0.0版了，所以虫友们在输版本号的时候不要搞错。
2.请最好将压缩包里的文件解压到Python27\Scripts目录下。
3.请将文件中以“numpy"和”pymol-1.8.2.0"开头的两个文件，文件名中的"cp27m"改为"none"，其他地方不变（注意不要改"cp27"啊!)
4.请按照19楼中所给的方法在cmd中输入命令，但是记得在输入第2-5条命令的时候，在install后面的内容中把文件路径补全。以第二条为例，不要只输入

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

而是要把install后面的路径补全，即

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install C:\Python27\Scripts\Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

注意以上几点，安装成功的几率应该就会大大提高。安装成功后在python27根目录下应该就会有一个图标显示的.exe文件，双击就能启动啦！

祝虫友们安装顺利！
PyMOL1.8.0.0 windows 64位版（应用最广泛的生物大分子显示软件）
QQ截图20170724184619.png
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62楼2017-07-24 18:56:34
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caochen

捐助贵宾 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

太棒了！！！！真好需要新pymol试一试
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4楼2016-02-26 22:35:56
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雙子の殇

金虫 (正式写手)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

楼主，我装上了软件可是打不开程序，打开是那种执行代码的界面
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8楼2016-03-01 21:37:02
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
11楼2016-03-05 20:18:54
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素炒河粉

新虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by xwnail2003 at 2016-03-05 20:18:54
LZ,我直接点击install_pymol.bat，但是cmc总是报错，这是怎么回事？如图

QQ图片20160305201731.png

同样问题，求帮助？谢谢
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15楼2016-03-08 22:15:02
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conanlp

银虫 (初入文坛)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

多谢分享！正需要！
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17楼2016-03-09 15:25:11
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fishhope

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by xwnail2003 at 2016-03-05 20:18:54
LZ,我直接点击install_pymol.bat，但是cmc总是报错，这是怎么回事？如图

QQ图片20160305201731.png

可能是没自动装好，手动安装即可，install_pymol.bat中的内容是：
echo Wheel installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install wheel

echo PWN Installation (for tkinter windows)
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

echo Numpy MKL Installtion
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

echo Pymol lib installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

echo PWN Graphic interface installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl

因此，打开一个命令行界面（按win+R输入cmd），然后执行：
C:\Python27\Scripts\pip.exe install wheel

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl
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20楼2016-03-16 21:16:04
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fishhope

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 素炒河粉 at 2016-03-08 22:15:02
同样问题，求帮助？谢谢...

可能是没自动装好，手动安装即可，install_pymol.bat中的内容是：
echo Wheel installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install wheel

echo PWN Installation (for tkinter windows)
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

echo Numpy MKL Installtion
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

echo Pymol lib installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

echo PWN Graphic interface installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl

因此，打开一个命令行界面（按win+R输入cmd），然后执行：
C:\Python27\Scripts\pip.exe install wheel

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl
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21楼2016-03-16 21:16:22
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audeline

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
我按照楼主说的执行下面一堆命令，可除了第一个命令外，其它都是looks like a file name,but the file does not exist. 关键是我把这些文件都复制到C:\Python27\Scripts\下也还是一样啊。

C:\Python27\Scripts\pip.exe install wheel

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install Pmw-2.0.1-py2-none-any.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install numpy-1.9.3+mkl-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe install pymol-1.8.0.0-cp27-none-win_amd64.whl

C:\Python27\Scripts\pip.exe  install pymol_launcher-1.0-cp27-none-win_amd64.whl
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27楼2016-05-04 09:52:26
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lusandanooo

银虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

超级感谢楼主！
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30楼2016-05-16 17:11:59
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fishhope

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
27楼: Originally posted by audeline at 2016-05-04 09:52:26
我按照楼主说的执行下面一堆命令，可除了第一个命令外，其它都是looks like a file name,but the file does not exist. 关键是我把这些文件都复制到C:\Python27\Scripts\下也还是一样啊。

C:\Python27\Scri ...

在有.whl的文件夹下执行这些命令

发自小木虫Android客户端
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31楼2016-05-19 10:41:08
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zqr153

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
20楼: Originally posted by fishhope at 2016-03-16 21:16:04
可能是没自动装好，手动安装即可，install_pymol.bat中的内容是：
echo Wheel installation
%PYTHONPATH%\Scripts\pip.exe install wheel

echo PWN Installation (for tkinter windows)
%PYTHONPATH%\Script ...

大神，还是没有装上，和他们的情况一样，紧急求助，八百里加急
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39楼2016-08-14 13:57:42
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Qin_2015

新虫 (初入文坛)

★★★ 三星级,支持鼓励

不太好装。
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41楼2016-09-04 12:10:02
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whui100012楼
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luwenwei3楼
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tulip200490995楼
2016-02-27 09:01   回复  
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12201638186楼
2016-02-27 15:23   回复  
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12201638187楼
2016-02-27 15:25   回复  
xufund9楼
2016-03-03 21:02   回复  
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yinjj10楼
2016-03-04 20:29   回复  
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kachow00312楼
2016-03-07 19:43   回复  
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panbin31213楼
2016-03-08 09:45   回复  
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素炒河粉14楼
2016-03-08 22:02   回复  
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sanmiao16楼
2016-03-09 08:16   回复  
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jerrychk18楼
2016-03-16 20:11   回复  
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wdx50722楼
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mengqianxun23楼
2016-04-02 15:34   回复  
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yellowstars724楼
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hermain25楼
2016-04-15 21:05   回复  
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audeline26楼
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liuyu_sdili28楼
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zhufadi29楼
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joker011532楼
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蓝色瓦尔登47楼
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sss217201448楼
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kongsong062049楼
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nfywilliam50楼
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