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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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yezhonghua09

金虫 (正式写手)

[求助] 计算结果出现错误提示原子距离太近已有1人参与

几何优化计算结果出现l202错误,提示原子距离太近(如图1)分子结构中有2个氢离得太近了,由于是共轭体系,用二面角调整工具会破坏分子构型。
请问GV画的时候怎么能够使得两个氢原子不至于太近(如图2)。是采用键长工具认为的缩短苯环上C-H键的长度么,这样可以么?
谢谢指教

计算结果出现错误提示原子距离太近
图1.png


计算结果出现错误提示原子距离太近-1
图2.png
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

2楼2016-02-21 10:28:35
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yezhonghua09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lastzealot at 2016-02-21 10:28:35
clean一下再优化

这是我clean后的情况,clean后2个氢原子就在一起了!
3楼2016-02-21 10:44:51
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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yezhonghua09: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-02-25 16:24:12
yezhonghua09: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-02-25 16:24:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by yezhonghua09 at 2016-02-21 10:44:51
这是我clean后的情况,clean后2个氢原子就在一起了!...

手动将它们调节一下,一个在面上,一个在面下。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-02-21 10:46:54
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