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cherryzhi

金虫 (正式写手)

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专业: 有机合成

[求助] 分子对接之前怎样处理配体？已有1人参与

如题，我再用auotodock vina做分子对接，在对接之前想对配体进行一下处理，使配体处于生物环境中的配体质子化状态，请问各位：1. autodock vina软件可以实现这个功能么？2. 如果不能，有什么软件可以实现？除了薛定谔，收费的，用不起啊！

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生命不息，奋斗不已

1楼 2016-02-04 11:36:01

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

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专业: 蛋白质组学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
cherryzhi: 金币+20, ★有帮助 2016-03-03 10:52:50

autodock对接都是理想状态对接的，溶液环境不能随意设置，文献中也鲜有类似的例子。。。

2楼2016-02-14 15:14:45

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