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tiny1979

金虫 (小有名气)

[交流] 求教细菌的鉴定

我刚接触这一个领域,所以不知如何下手,请各位大虾指点。
我手上有一种菌,在植物培养基上已知能生长,颜色为橙黄色,有点粘,而且好像对植物的生长有促进作用,因此我想对它进行鉴定,以确定其功能。
问题是这样的:
我不知从哪几个方面进行鉴定较为快捷有效,目前我了解到细菌(从生长的状态看似为细菌)的鉴定主要有形态观察、生理生化测定和分子鉴定。那么这几个方面应分先后顺序进行(比如先通过形态观察确定大致属于哪一类,再进行16srDNA鉴定)还是同步进行?也就是说利用通用引物对根不未知的细菌进行16srDNA的PCR鉴定结果可靠么?而且我查到的27F,1492R这对通用引物好像都有不同的序列,不知到底那对引物较好,还是需要自己摸索?
呵呵,问题挺多的,有劳大虾的帮助,即使给予一点解疑我都感激不尽,先谢过!
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liuyichen1982

铜虫 (初入文坛)

1:可以同步进行
2:我们实验室通常会先鉴定16srDNA
3:我们用这对引物
16sR        AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
16sF        TACCTTGTTACGACTT
2楼2008-10-07 10:48:30
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tiny1979

金虫 (小有名气)

liuyichen1982  ,谢谢你!
另外,我还有个问题,由于这种细菌是我在植物培养过程中发现的,它在植物培养温度25度时是上述的形态和颜色,那么我在做鉴定之前的细菌平板培养温度该用一般的37度还是用25度,或两者都用以做比较?
3楼2008-10-07 11:34:36
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