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942475539

木虫 (著名写手)

[求助] S8分子的分子结构优化 geometry optimization 已有1人参与

想优化硫8分子的结构,使用Dmol3模块,但是一直得不到理想的结果,附上一些参数图片

S8分子的分子结构优化 geometry optimization
S8分子结构优化.jpg
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。。 2016-02-17 11:07:09
942475539: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-02 22:12:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by 942475539 at 2016-01-24 13:31:11
是画完分子结构后点clean按钮一下吗
...

不只是clean的问题,比如八个硫原子的体系,你建立一个正六面体,和一个线型的初始结构,它们经过优化,最后得到的结构应该也会不同。可以参照以前很多金团簇的计算工作。

发自小木虫Android客户端
快乐科研,快乐生活。
4楼2016-01-24 13:41:41
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chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.

快乐科研,快乐生活。
2楼2016-01-24 10:54:50
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942475539

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chimegreen at 2016-01-24 10:54:50
跟初始结构有关

是画完分子结构后点clean按钮一下吗

发自小木虫Android客户端
3楼2016-01-24 13:31:11
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942475539

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chimegreen at 2016-01-24 13:41:41
不只是clean的问题,比如八个硫原子的体系,你建立一个正六面体,和一个线型的初始结构,它们经过优化,最后得到的结构应该也会不同。可以参照以前很多金团簇的计算工作。
...

硫8分子就是皇冠型的结构啊,我clean一下后,发现键长和键角和理论值是一致的,然后用Dmol3模块优化后分子结构看着挺符合的

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-24 20:23:10
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