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冷眼倦天涯

金虫 (小有名气)

[求助] 如何查看测序的数据类型是sanger type，illumina type？ 已有1人参与

如何查看测序的数据类型是sanger type，illumina type？
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1楼 2016-01-20 20:52:22
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lifechuteng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
sanger属于一代测序，一般测定某个基因或长片段的序列，单次有效读长比illumina的长，一般在800bp左右，有测序峰图。
illumina属于二代测序，一般可以用来测定一个样本基因组的全序列，单次读长短但是通量很大，最后结果是需要软件将大量的短片段进行拼接才能得到。
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2楼2016-01-21 10:05:23
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冷眼倦天涯

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lifechuteng at 2016-01-21 10:05:23
sanger属于一代测序，一般测定某个基因或长片段的序列，单次有效读长比illumina的长，一般在800bp左右，有测序峰图。
illumina属于二代测序，一般可以用来测定一个样本基因组的全序列，单次读长短但是通量很大，最 ...

我是得到一些数据，如果查看是什么类型的，Your base quality format appears a sanger type, but the job will be processed with illumina type  软件总是这样提示
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3楼2016-01-21 23:12:09
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