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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

[求助] 进行Gaussian计算,总不成功,请问怎么解决?谢谢! 已有3人参与

用MS截出图片里的晶胞,进行Gaussian计算,计算一会之后,结构就散了,Co和O之间的键总是断裂。结构是看文献里面截的(文献未给出相应的键长和键角),不知道怎么解决,请大家帮忙,先谢谢了!
1是文献里面的图,2是我参考文献自己截的图,3是优化后的图(优化不成功)。

进行Gaussian计算,总不成功,请问怎么解决?谢谢!
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进行Gaussian计算,总不成功,请问怎么解决?谢谢!-1
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进行Gaussian计算,总不成功,请问怎么解决?谢谢!-2
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yangxing0827

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
轩辕诗柯: 金币+1 2016-01-24 11:43:55
轩辕诗柯: 金币+4 2016-01-24 11:44:30
有些键的作用较弱的时候,gaussian就有可能会认为之间没有成键。你把chk文件转化为fchk文件后,有gaussian打开,就可能log文件没有见连接的键现在连上了。所以gaussian view中如果有两个原子没有键并不奇怪。另外用multiwfn等软件也可以考察这两个原子是否成键。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

自信,理解
3楼2016-01-21 17:20:59
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普通回帖

youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不要把重点放在键上,而是原子原子之间的距离!如果你是在觉得不舒服自己把他连上不久得了吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

平生多磨砺,男儿自横行!
2楼2016-01-20 21:52:40
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2016-01-20 21:52:40
不要把重点放在键上,而是原子原子之间的距离!如果你是在觉得不舒服自己把他连上不久得了吗?

恩,我看文献上优化之后是连着的,我的不连着,我把原子距离改小之后,优化一会还是会断开。我想知道是什么原因。

发自小木虫Android客户端
4楼2016-01-22 13:27:52
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2016-01-20 21:52:40
不要把重点放在键上,而是原子原子之间的距离!如果你是在觉得不舒服自己把他连上不久得了吗?

嗯嗯,好的,非常感谢您,我按照您的方法试一下,如果有什么不懂,希望再得到您的帮助!

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-22 13:28:49
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by yangxing0827 at 2016-01-21 17:20:59
有些键的作用较弱的时候,gaussian就有可能会认为之间没有成键。你把chk文件转化为fchk文件后,有gaussian打开,就可能log文件没有见连接的键现在连上了。所以gaussian view中如果有两个原子没有键并不奇怪。另外用 ...

前俩天在火车,没有及时回复您,非常感谢,我按照您说的,我试一下,希望有什么不懂得,可以再次得到您的帮助!

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-22 13:31:01
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2016-01-20 21:52:40
不要把重点放在键上,而是原子原子之间的距离!如果你是在觉得不舒服自己把他连上不久得了吗?

你好,原子之间的距离是结构里的,我并没有做改变,可是优化的结果显示不是正常优化结束啊?后来按照您说的改变了距离,结构就与优化之前差别很大,整个都散了,还是不成功啊!
7楼2016-01-24 11:55:07
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yangxing0827 at 2016-01-21 17:20:59
有些键的作用较弱的时候,gaussian就有可能会认为之间没有成键。你把chk文件转化为fchk文件后,有gaussian打开,就可能log文件没有见连接的键现在连上了。所以gaussian view中如果有两个原子没有键并不奇怪。另外用 ...

你好,刚刚接触高斯,请您详细的教一下可以吗?第一,我不会将chk转换为fchk(在小木虫查了,试了几天,还是没弄明白)第二,您有multiwfn这个软件吗?可以发一份吗?
8楼2016-01-24 11:58:44
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
轩辕诗柯: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-01-25 20:03:15
不用选择优化,直接计算单点能,附带算电荷就可以了,利用pop=chelpg,重金属与其他原子使用混合基组。

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好好学习,天天向上。
9楼2016-01-24 15:15:58
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轩辕诗柯

金虫 (小有名气)

嗯嗯,我想计算这个结构的电荷得失,与差分电荷图一起看。

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10楼2016-01-25 20:05:00
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