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yalefield金虫 (文坛精英)
老汉一枚
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[交流]
关于QSAR原理的书籍
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俺在坛子里发过一些关于QSAR理论和趋势的综述性文献，但很少发具体的例子。 其实，正是QSAR思想使化学之所以是科学而不是巫术。如果分子的结构与性能之间没有规律，我们作为化学家还能干什么？ QSAR方法的本质，是统计学。更具体地说，是建立在统计基础之上的模式识别。目前所有化学类的书籍，对此都是语焉未详。李仁利的那本书，还算比较专业，例子很丰富。此外，化学计量学的几本书，也谈了一些，但内容都比较浅，特别是在数学/统计学基础上，对化学领域的读者来说，没什么参考价值。能看懂的人，嫌它太浅，说明不了问题；看不懂的，则嫌它太深。 因此，你如对QSAR思想感兴趣，并且要想从原理/方法上提高自己的水平，可以看看电子工业出版社的两本书：《统计学习基础》、《统计模式识别》，都是翻译过来的。 以前的帖子： 呵呵，先上两盘QSAR老菜：有机结构体积的加合性 http://muchong.com/html/200711/622533.html 再尝尝“去火”的苦算子： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=622535 [ Last edited by woshilsh on 2009-6-13 at 22:15 ] |
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前辈你好 您的很多帖子我已经拜读过了 我本人是搞药物化学的 主要研究的是有机合成这一块 但每天都是在实验室里盲目的搞些重复的合成实验 时间长了东西倒是很多但总觉得这样搞下去没有什么指导性 很累人不说 到头来三年只是一直在拚命的合成 我现在马上就要研三了 前不久在听一次报告时偶然接触了QSAR 觉得有点相见恨晚的感觉 回来后这几天就一直在找这方面的资料在看 之前找了不少资料书籍 大都是在讲关于统计方面的数学知识 看得我云里雾里 后来看了您的帖子 拜读了李老师的 药物构效关系 受益非浅 对基本的2D-QSAR有了一些了解 但还是觉得不知道该如何下手 再过一阵子就要开始写毕业论文了 我想把自己这两年多来作的几十个化合物利用2D-QSAR作一下简单的规律性的总结 希望前辈能够帮我指点一下 有没有什么建议可以帮我提一下 鉴于以前没有过相关的研究经验 您是否可以给我推荐几种比较容易上手的软件并希望您能简单介绍一下这些软件在研究QSAR方面究竟是做什么用的 可能我提的这些问题有些幼稚还希望前辈谅解 见笑见笑 [ Last edited by jinlei on 2009-6-11 at 16:51 ] |
5楼2009-06-11 16:49:24
yalefield
金虫 (文坛精英)
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数理功底不太好的，可以先看一些搞化学的人写的统计方面的书，结合具体的化学问题，比较容易理解，如： 许禄： 化学计量学 罗旭：化学统计学 陈念贻：模式识别方法在化学化工中的应用 有了一定理解和实践后，可以看一些更专业点的，如 边肇祺：模式识别 张学工（译）：统计学习的本质 商业软件做得太好，带来的一大缺点就是不求甚解，误人子弟。比如CoMFA,容易上手吧？只要跟着教程操作几遍就会了。后果呢？有人用了三年的CoMFA,结果论文送审时连最基本的关于PLS的问题都回答不了，跑来问我这个CoMFA只用过两星期的人。 也有的人， 聚类分析软件用了几年，连什么叫single linkage都不知道。悲乎？ |
6楼2009-06-12 08:48:40
