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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请教关于引物的设计方面的问题。
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proteinwang

铜虫 (正式写手)

[交流] 请教关于引物的设计方面的问题。

在设计引物时，5‘端加上限制性内切酶序列和几个碱基后，一般怎样计算所设计的引物的Tm？
另外，EcoO109I (DraII)：RG↓GNCCY中，R和Y以及内部的N分别代表什么呢？
初次进行，引物设计，请多指教。
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1楼 2008-10-03 15:19:04
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
个人建议，前面几个循环的Tm，就按照不加酶切序列和保护碱基的，完全互补配对的那段来算Tm
后面的几个循环，就可以按照加了酶切序列和保护碱基的
嘌呤=R
嘧啶=Y
任何碱基=N
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2楼2008-10-03 16:04:14
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proteinwang

铜虫 (正式写手)
谢谢楼上朋友的解答
我是想问一下，怎么计算所设计好的引物的长度？
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3楼2008-10-03 23:14:37
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chenliang_0513

铁杆木虫 (职业作家)
你是怎么设计引物的？
难道不用软件?
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我本将心向明月,奈何明月照沟渠?
4楼2008-10-04 11:09:35
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