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proteinwang

铜虫 (正式写手)

[交流] 请教关于引物的设计方面的问题。

在设计引物时,5‘端加上限制性内切酶序列和几个碱基后,一般怎样计算所设计的引物的Tm?
另外,EcoO109I (DraII):RG↓GNCCY中,R和Y以及内部的N分别代表什么呢?
初次进行,引物设计,请多指教。
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

个人建议,前面几个循环的Tm,就按照不加酶切序列和保护碱基的,完全互补配对的那段来算Tm
后面的几个循环,就可以按照加了酶切序列和保护碱基的
嘌呤=R
嘧啶=Y
任何碱基=N
2楼2008-10-03 16:04:14
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proteinwang

铜虫 (正式写手)

谢谢楼上朋友的解答
我是想问一下,怎么计算所设计好的引物的长度?
3楼2008-10-03 23:14:37
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chenliang_0513

铁杆木虫 (职业作家)

你是怎么设计引物的?
难道不用软件?
我本将心向明月,奈何明月照沟渠?
4楼2008-10-04 11:09:35
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