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moneymaker

银虫 (正式写手)

[交流] 一个审稿人提出的问题,请大家帮助解答 ?

论文投出去了,一个审稿人提出的问题.真把我问住了,请大家帮我想想怎么回答为好.

他提出我的实验倍数变化不大,GAPDH内参并不是个稳定的内参, 所以实验数据的可靠性不大.

我是这样解释的: 因为我做的是体内亚慢性染毒试验,不像做细胞培养,直接刺激细胞,所以倍数变化不大是正常的.我的数据在1.5-2.5倍数之间.年

但是在内参选择上,因为不是学生物的,没有一点PCR基础, 也没有想别的当时就拿GAPDH座内参了,后来才听说用18S作为可靠. 我没有找到相关文献用GAPDH的.

因为3个审稿人,2个通过,一个提出这个问题.所以很关键.请大家帮个忙我该怎么回答呢?
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argnout

金虫 (小有名气)

补做
用可靠的内参
2楼2008-10-03 18:05:56
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

内参还有很多
actin和tublin都可以
3楼2008-10-03 18:09:04
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boouy

银虫 (正式写手)

重要的是你需要验证你所采用内参的合理性,一方面来自文献,别人已用的话最好;另一方面如果有大量的芯片数据可以查询,则可以看看这个内参的表达水平时候具有housekeeping基因的特点。这两点都不行的话,只有重做了!
4楼2008-10-04 10:01:54
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xiaomuchong872

金虫 (小有名气)

楼主用GAPDH做什么的内参啊
我做细菌的也想用它呢
也是没有细菌方面的文献
不知道可靠不
放弃破罐子破摔
5楼2008-10-04 16:10:30
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moneymaker

银虫 (正式写手)

我就是坐荧光定量RT-PCR. 作之前还是考虑好吧 .否则会有麻烦的
6楼2008-10-05 09:02:18
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xiaomuchong872

金虫 (小有名气)

楼主有比较好的资料吗
可不可以发到我邮箱
liuyanzhi123@126.com
谢谢
放弃破罐子破摔
7楼2008-10-05 15:34:09
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