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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 请问：用454核糖体RNA基因测序，能不能把土壤细菌（或真菌）分类到种的水平？
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请问：用454核糖体RNA基因测序，能不能把土壤细菌（或真菌）分类到种的水平？ 已有3人参与

请问一下大家：用454核糖体RNA基因测序，能不能把土壤细菌（或真菌）分类到种的水平？
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control
1楼 2016-01-16 17:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

崔士元

金虫 (正式写手)
测序得到的reads到数据库比对，数据库中能比对到就可以鉴定到种，如果数据库没有这个序列，估计只能找相似性高的属

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woziyuan
男人，就要对自己狠一点！
2楼2016-01-16 23:10:45
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
woziyuan: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-01-18 22:31:33
二代测序技术不行，三代测序技术可以，到错误率太高！

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2016-01-17 01:04:19
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juliusluan78

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以，但太不准确，大多是400bp左右的序列，尤其是真菌，更不准确
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

woziyuan
坚持就是胜利
4楼2016-01-17 09:41:17
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
感谢参与，应助指数 +1
目前获得的序列，有个局限性是看库里面有没有。序列越长，就可以好的对应到
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

woziyuan
5楼2016-01-18 11:03:46
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 崔士元 at 2016-01-16 23:10:45
测序得到的reads到数据库比对，数据库中能比对到就可以鉴定到种，如果数据库没有这个序列，估计只能找相似性高的属

好的，谢谢指教！！
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control
6楼2016-01-18 22:30:40
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2016-01-17 01:04:19
二代测序技术不行，三代测序技术可以，到错误率太高！

好的，谢谢指教！
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control
7楼2016-01-18 22:31:15
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by juliusluan78 at 2016-01-17 09:41:17
可以，但太不准确，大多是400bp左右的序列，尤其是真菌，更不准确

好的，谢谢指教！
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control
8楼2016-01-18 22:32:30
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 美亿美生物 at 2016-01-18 11:03:46
目前获得的序列，有个局限性是看库里面有没有。序列越长，就可以好的对应到

好的，谢谢指教！
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control
9楼2016-01-18 22:33:01
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woziyuan

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 崔士元 at 2016-01-16 23:10:45
测序得到的reads到数据库比对，数据库中能比对到就可以鉴定到种，如果数据库没有这个序列，估计只能找相似性高的属

好的，谢谢指教！
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control
10楼2016-01-18 22:33:19
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