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汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药接受调剂
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BOLT创造奇迹

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps中所建聚合物模型,relaxation中压强始终不能收敛到很小 已有1人参与

我在Material studio里面amorphous cell -->calculation建立了聚合物的分子模型,用的是cvff的力场,然后用lammps生成了data文件进行拉伸计算,但遇到了如下问题:

在relaxation阶段,我发现那个press和pzz怎么都relax不到我想要的1bar,并且相差甚远, 有时候正几千,有时候负几千,不收敛到1 bar。我想如果pzz不收敛到很小的话,接下来的拉伸也没法进行,因为应力会很不正常,该怎么办?我在lammps中用的npt, 也试了下组合的nvt-nve-npt, 但都解决不了问题。我在想能够在MS中改怎么调整,或者lammps中该怎么调整?

谢过各位!
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tang_wei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
BOLT创造奇迹: 金币+10, 有帮助 2016-01-18 03:38:33
我原来也问过别人这个问题,有个大神说log文件里面的press是瞬时压强,不是体系的压强。体系的具体压强要进行积分
2楼2016-01-16 10:16:38
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BOLT创造奇迹

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-16 10:16:38
我原来也问过别人这个问题,有个大神说log文件里面的press是瞬时压强,不是体系的压强。体系的具体压强要进行积分

应该是瞬时压强,average一下貌似可以了。谢谢啊
3楼2016-01-18 03:39:07
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引用回帖:
2楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-16 10:16:38
我原来也问过别人这个问题,有个大神说log文件里面的press是瞬时压强,不是体系的压强。体系的具体压强要进行积分

4楼2016-01-19 22:55:27
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青丘白浅

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by BOLT创造奇迹 at 2016-01-18 03:39:07
应该是瞬时压强,average一下貌似可以了。谢谢啊...

你好,请问怎样实现压强平均?
5楼2017-11-27 16:30:48
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青丘白浅

新虫 (初入文坛)

你好,楼主,我也在做聚合物的相关研究,用material studio中amorphous cell -->calculation建立了聚合物的分子模型,通过这种方法得到的分子链有些是跑出模拟盒子的,但是在lammps里所有粒子都是在模拟盒子中的,想请教一下这个怎么问题在由ms文件转为data文件过程中怎么解决。
6楼2017-11-27 16:38:06
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