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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps中dump原子坐标，x, y,z, xs,ys,zs,xu,yu,zu具体是什么意思啊
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BOLT创造奇迹

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps中dump原子坐标，x, y,z, xs,ys,zs,xu,yu,zu具体是什么意思啊 已有1人参与

如下：
x,y,z = unscaled atom coordinates
xs,ys,zs = scaled atom coordinates
xu,yu,zu = unwrapped atom coordinates

这里的scale， unwrapped， 到底是什么含义，该如何理解呢？谢过！
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1楼 2016-01-14 23:55:43
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
BOLT创造奇迹: 金币+15, ★★★很有帮助 2016-01-16 02:38:39
先看一下scale的定义
一个点，是不是可以通过坐标变换变成到一个(0 0 0)->(1 1 1)的方盒子里：
(x - xlo)/(xhi - xlo)
(y - ylo)/(yhi - ylo)
(z - zlo)/(zhi - zlo)
这就是scale过的坐标

这样unscale就好理解了

unwrap跟周期边界有关，如果跑出simulation box，边界又是周期的话，是不是可以wrap回盒子呢。这就是wrap和unwrap。
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2楼2016-01-15 03:11:26
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BOLT创造奇迹

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-01-15 03:11:26
先看一下scale的定义
一个点，是不是可以通过坐标变换变成到一个(0 0 0)->(1 1 1)的方盒子里：
(x - xlo)/(xhi - xlo)
(y - ylo)/(yhi - ylo)
(z - zlo)/(zhi - zlo)
这就是scale过的坐标

这样unscale就 ...

ok,应该是你说的这样的，多谢了。
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3楼2016-01-16 02:37:58
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Stoudemire29

金虫 (小有名气)
学习了
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共同进步
4楼2018-11-12 11:33:30
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amynihao

金虫 (正式写手)

寂寞大虫
学习了
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不是要做一个单纯优秀的人，而是要做一个不可替代的人。
5楼2020-08-12 13:44:44
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suihg

金虫 (职业作家)
学习了！
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6楼2020-08-26 20:19:28
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