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yijiaobani

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[资源] A Guide to QTL Analysis in GenStat 书籍分享(已经搜索,无重复)

初步翻译一下目录:
1 GenStat软件定位QTL系统初步介绍
1.1 GenStat定位QTL的方法:连锁分析和关联分析
1.2 窗口视图
1.3 例子介绍,CIMMTY的玉米F2数据,小麦数据,大麦数据
1.4 定位的pipeline

2 导入和检测表型数据和基因型数据

3 带试验设计的表型数据如何分析
3.1 单环静
3.2 性状均值
3.3 计算遗传力
3.4 -3.8 各种试验设计的数据,不如随机区组、不完全区组、空间分析等

4 多环境QTL定位分析
4.1 基因型与环境互作
4.2 多年多点数据的分析
4.3 方差协方差模型(Identity、Compound symmetry、Diagonal、Factor analytic of order k等)
4.4-4.5 基因与环境互作(AMMI模型、GGE biplot模型)

5 构建图谱
5.1 重组数
5.2 分组
5.3 构建图谱

6 单环境单位点QTL定位分析

7 多性状单环境QTL分析、单性状多环境QTL分析

8 cross pollinate群体,即是cp群体,双亲为F1杂合的QTL定位方法

9 关联分析,包括系谱信息、分组信息、多性状多环境关联分析

10 介绍线性混合模型
10.1 线性混合模型
10.2 理解随机因子
10.3 更加复杂的随机因子结构
10.4 随机模型的比较标准
10.5 随机因子的预测,最佳线性无偏预测(blup)
10.6 评价固定因子
107 模型检测和适合性检测
10.8 混合线性模型的分析流程
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  • 附件 1 : A_Guide_to_QTL_Analysis_in_GenStat.pdf
  • 2016-01-12 19:20:13, 4.87 M

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