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abbott

金虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】How to run G03 Efficiently? Personal Experience

高效率执行高斯运算
                           -----高斯计算任务的内存分派
所依据的工具，G03自带的工具freqmem
在我所使用的机器上，碰到以下两种使用方法：

1
freqmem natoms nbasis r|u c|d functions

各参数意义如下：

natoms       分子系统内的原子数目
nbasis       所用基底函数组内的函数总数
r|u          r 表示填满状态，u 表示未填满状态
c|d             c 表示传统方法，d 表示直接方法
functions    选用的基底函数类型（sp，spd，spdf 等等）

下面的是一个使用范例：

$ freqmem 113 361 r d sp

RHF direct frequencies with sp functions:

One pass requires 44.80 megawords.

输出数据显示这程序需要大约 360 MB 内存容量才能一次处理频率计算工作。

2

Usage:  freqmem number-of-atoms number-of-basis-functions rhf/uhf conventional/direct sp/spd/spdf

参数的意义和上面的几乎一致。

其中：

conventional: 类似于经验算法

direct：直接接薛定谔方程，直接解约化矩阵。

看到过一篇文章，讲的是如何高效的执行G03运算的。

上面特别的提到，对于G03计算任务，分配的内存一定要足够，否则运行效率将十分低下；

但是所分派的内存也不要认为是越大越好，如同高斯的官方技术资料说的一样，enough memory, but not more.

如果分派的内存过多，也会导致计算效率十分低下。

一个体系的合适的内存容量，取决于计算的方法和使用的基组的大小。

可以采用上面的工具来大致的估算。

这样才能保证G03的高效的运行。

内存量一定要足够，但不能太多！Enough but NOT more!!!

这个也是我个人目前得到的一点点经验，如果有不对的地方，请大家多多指正，一起交流共同成长！

欢迎大家拍砖！！！

更详尽的内容可以参考：
http://www.gaussian.com/g_ur/m_eff.htm

期待指正：abbott.cn@gmail.com

[ Last edited by mingdong on 2009-9-13 at 18:54 ]

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