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sisilucy

新虫 (初入文坛)

[交流] 并行程序调用BLAS库时出现的问题~不知道有没有人遇到过 已有2人参与

我调用了BLAS库中的矩阵相乘函数zgemm,但实际上只是想实现向量乘以矩阵的功能,在串行情况下测试的时候,将矩阵的规模缩减一半,计算时间也会缩减一半,但是在MPI并行情况下,矩阵的规模缩减了一半,计算时间并没有减一半。我觉得没有内存读取上的问题,不知道是什么原因,求帮忙~
PS. 听说BLAS库的函数是可以并行计算的,就是说在串行的情况下调用了zgemm,但是内部可能会启动并行计算,有选项可以控制这个,不知道有没有大神知道这个问题,我搜了一下,也没有找到有关的资料,求解答~
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sisilucy

新虫 (初入文坛)

2楼2016-01-10 16:28:27
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fmying

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果只是矩阵和向量的相乘的话,用ZGEMV就可以了。
另外,你在MPI并行的时候是如何处理数据的?能否给出代码看看?
BLAS可以并行不假,但是你是否用了并行的BLAS?如果用的是串行的BLAS,那么就不会自己偷偷并行。
我自己似乎没有遇到过你说的这类问题。
上善若水
3楼2016-01-11 22:22:03
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Carpathia

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你说没有减少一半,在并行时,时间没有减少一半是完全可能的,加速比不会是理想情况
追求理想的道路上东张西望
4楼2016-01-12 13:52:12
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sisilucy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话,用ZGEMV就可以了。
另外,你在MPI并行的时候是如何处理数据的?能否给出代码看看?
BLAS可以并行不假,但是你是否用了并行的BLAS?如果用的是串行的BLAS,那么就不会自己偷偷并行。 ...

我是想算向量和矩阵相乘,向量有一个共轭的步骤,所以用的是矩阵和矩阵相乘

发自小木虫IOS客户端
5楼2016-01-13 14:06:21
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sisilucy

新虫 (初入文坛)

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3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话,用ZGEMV就可以了。
另外,你在MPI并行的时候是如何处理数据的?能否给出代码看看?
BLAS可以并行不假,但是你是否用了并行的BLAS?如果用的是串行的BLAS,那么就不会自己偷偷并行。 ...

我用的是串行的blas 函数,如果是mkl和gotoblas2的话,有可能会启动多线程,这是我刚刚查到的,如果并行调用的话,启动多线程可能会导致并行效率不高,也只是我的想法,不知道有没有人曾经有过类似的经验

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6楼2016-01-13 14:08:59
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sisilucy

新虫 (初入文坛)

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4楼: Originally posted by Carpathia at 2016-01-12 13:52:12
你说没有减少一半,在并行时,时间没有减少一半是完全可能的,加速比不会是理想情况

我也是这样想的,但是并行效率只有70%,只是很简单的过程,只有向量和矩阵相乘,向量和向量相乘,我觉得有点不正常

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7楼2016-01-13 14:12:37
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sisilucy

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话,用ZGEMV就可以了。
另外,你在MPI并行的时候是如何处理数据的?能否给出代码看看?
BLAS可以并行不假,但是你是否用了并行的BLAS?如果用的是串行的BLAS,那么就不会自己偷偷并行。 ...

关于数据处理,我直接从文件中读取到数组中,就直接调用blas函数了,没有什么特别的

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8楼2016-01-13 14:14:53
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