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sisilucy

新虫 (初入文坛)

[交流] 并行程序调用BLAS库时出现的问题~不知道有没有人遇到过 已有2人参与

我调用了BLAS库中的矩阵相乘函数zgemm，但实际上只是想实现向量乘以矩阵的功能，在串行情况下测试的时候，将矩阵的规模缩减一半，计算时间也会缩减一半，但是在MPI并行情况下，矩阵的规模缩减了一半，计算时间并没有减一半。我觉得没有内存读取上的问题，不知道是什么原因，求帮忙~
PS. 听说BLAS库的函数是可以并行计算的，就是说在串行的情况下调用了zgemm，但是内部可能会启动并行计算，有选项可以控制这个，不知道有没有大神知道这个问题，我搜了一下，也没有找到有关的资料，求解答~
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1楼 2016-01-10 16:09:49
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sisilucy

新虫 (初入文坛)
自己顶

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2楼2016-01-10 16:28:27
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fmying

银虫 (小有名气)
★
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如果只是矩阵和向量的相乘的话，用ZGEMV就可以了。
另外，你在MPI并行的时候是如何处理数据的？能否给出代码看看？
BLAS可以并行不假，但是你是否用了并行的BLAS？如果用的是串行的BLAS，那么就不会自己偷偷并行。
我自己似乎没有遇到过你说的这类问题。
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上善若水
3楼2016-01-11 22:22:03
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Carpathia

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你说没有减少一半，在并行时，时间没有减少一半是完全可能的，加速比不会是理想情况
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追求理想的道路上东张西望
4楼2016-01-12 13:52:12
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sisilucy

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3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话，用ZGEMV就可以了。
另外，你在MPI并行的时候是如何处理数据的？能否给出代码看看？
BLAS可以并行不假，但是你是否用了并行的BLAS？如果用的是串行的BLAS，那么就不会自己偷偷并行。 ...

我是想算向量和矩阵相乘，向量有一个共轭的步骤，所以用的是矩阵和矩阵相乘

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5楼2016-01-13 14:06:21
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sisilucy

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3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话，用ZGEMV就可以了。
另外，你在MPI并行的时候是如何处理数据的？能否给出代码看看？
BLAS可以并行不假，但是你是否用了并行的BLAS？如果用的是串行的BLAS，那么就不会自己偷偷并行。 ...

我用的是串行的blas 函数，如果是mkl和gotoblas2的话，有可能会启动多线程，这是我刚刚查到的，如果并行调用的话，启动多线程可能会导致并行效率不高，也只是我的想法，不知道有没有人曾经有过类似的经验

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6楼2016-01-13 14:08:59
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sisilucy

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4楼: Originally posted by Carpathia at 2016-01-12 13:52:12
你说没有减少一半，在并行时，时间没有减少一半是完全可能的，加速比不会是理想情况

我也是这样想的，但是并行效率只有70%，只是很简单的过程，只有向量和矩阵相乘，向量和向量相乘，我觉得有点不正常

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7楼2016-01-13 14:12:37
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sisilucy

新虫 (初入文坛)
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3楼: Originally posted by fmying at 2016-01-11 22:22:03
如果只是矩阵和向量的相乘的话，用ZGEMV就可以了。
另外，你在MPI并行的时候是如何处理数据的？能否给出代码看看？
BLAS可以并行不假，但是你是否用了并行的BLAS？如果用的是串行的BLAS，那么就不会自己偷偷并行。 ...

关于数据处理，我直接从文件中读取到数组中，就直接调用blas函数了，没有什么特别的

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8楼2016-01-13 14:14:53
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