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abczhuazhua

铜虫 (初入文坛)

[交流] 请问,启动子区两个相同的元件是否都有可能是已知转录因子的binding? 已有2人参与

我现在预测到我的启动子区有2个W-box,那么如果我分别把这两个W-box做成探针,和已知的转录因子做EMSA,若两者间都有结合,能不能说明在体内这两个W-box也都有作用?

另外,如果我的材料是杂合的,即二倍体的一条同源染色体发生SNP,破坏掉了W-box,那么植物体内这种结合作用是不是减少了一倍?
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fengshen2005

银虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
EMSA只是验证蛋白与DNA的体外结合,体内是否真的结合需要ChIP检测,至于体内是否起作用,作用多大,就要看表达水平,不一定与元件数量成正比

发自小木虫Android客户端
2楼2016-01-21 23:31:24
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fengshen2005

银虫 (正式写手)

转录过程很复杂,结合只是迈出了第一步

发自小木虫Android客户端
3楼2016-01-21 23:32:38
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福建漳浦

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
同样的,你也可以用DNA-pulldown进行验证,再结合western,祝你好运
4楼2016-02-13 16:33:58
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