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qasd

木虫 (著名写手)

[交流] discover分析求助

使用discover分析轨迹,得到MSD,出现了以下问题
1、MSD的起点不是(0,0).而是起始在y轴有一个值
2、MSD的线性有波动,有时波动很大(统计300ps)
3、使用MSD求扩散系数的数量级不对,根据数据画MSD与t的曲线算斜率,此处单位应该是埃的平方/ps,即10-8(m的平方/s);  最后将斜率除以6得到自扩散系数,是10-8量级,而实验值是10-5次

为什么会出现以上情况?求高手指点,多谢!
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saitou

木虫 (正式写手)

沙发

起点不是0因为第一个取样点是0时刻+设定的取样间隔(比如1000fs)

前50 000step没有统计学意义,应该略去。其他问题的关键我也不知,没做过msd
不抛弃,不放弃
2楼2008-09-29 10:39:16
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