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wanchaofan

新虫 (初入文坛)

[求助] 水样中细菌种类的鉴定 已有4人参与

请问有什么办法可以确定某一水样中的所有菌的种类,最好是能具体到种的方法
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唐不苦

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
涂平板,纯化出单菌落,做个16s,送测序公司

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2016-01-07 10:10:07
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wanchaofan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 唐不苦 at 2016-01-07 10:10:07
涂平板,纯化出单菌落,做个16s,送测序公司

这种方法肯定会漏掉很多细菌种类的,有没有别的方法
3楼2016-01-07 14:10:43
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snake

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先对水样微生物进行富集,然后选取不同类型的培养基涂平板,纯化出单菌落,根据简单的菌落形态及生理生化试验区分大致类别,然后做个16s,送测序公司
4楼2016-01-08 16:46:09
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wulin728

新虫 (初入文坛)

5楼2016-01-10 07:22:44
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hang0604

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你可以问问有没有专门提取水中16S总DNA的提取试剂盒,然后去做个高通量就行了
6楼2016-01-10 10:15:15
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崔士元

金虫 (正式写手)

直接把水样用0.22微米滤膜过滤,滤膜交给公司提取总DNA,进行微生物多样性分析,价格不贵

发自小木虫IOS客户端
男人,就要对自己狠一点!
7楼2016-01-13 10:02:45
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wanchaofan

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hang0604 at 2016-01-10 10:15:15
你可以问问有没有专门提取水中16S总DNA的提取试剂盒,然后去做个高通量就行了

请问做个高通量的话可以鉴定到种吗?
8楼2016-01-14 20:59:17
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

做三代扩增子测序可以到种,但是我问了好几次,没人愿意做,
致良知
9楼2016-01-15 17:19:19
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