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yang2325182

金虫 (正式写手)

[交流] 酶活定义

大家好,我最近在做一个固定化酶相关的实验,需要比较固定化酶(immobilized enzyme)与游离酶(free enzyme)之间一些性质的差异。
我看文章上大家基本都是用relative activity来表示没活性的差异,比如说把某个催化活性作为百分之百,其他的跟他比,而在实际实验测量
过程中,有些人是将反应生成物啊,hplc峰面积啊等等作为酶活力的衡量指标。
我想请问一下,这种相对的设定是有一定的规矩的吗?还是说必须要测量米氏常数来衡量。因为从米氏常数的定义来看的话,在反应经过较长
时间之后,确实是不能够很好的反应酶与底物的亲和性,而作为初始反应速率的米氏常数可能会更合适吧。
所以在此发帖,希望能够得到虫友的帮助,求指点,我到底该用哪个来作为我的酶活呢?

另外,我想问一下,我是否可以选择合适的底物浓度与酶浓度,确保我的底物水解量保持在短时间内(5min内)处于一个较低的水解率(小于10%)这样,保证底物还是处于一个较高的浓度,这样的底物的水解量,是否可以代表初始反应速率?而我不需要去计算米氏常数km kcat(由于反应难于监测,测量误差经过计算会很大)直接用这样的底物水解值做一个relative activity?

求大神指点~~
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o(╯□╰)o
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yang2325182

金虫 (正式写手)

引用回帖:
67楼: Originally posted by 琉璃月028 at 2016-08-11 22:19:12
借此机会再请教您几个问题吧,在做固载酶的时候,我看文章会将固载酶的活性与自由酶的活性进行比较。我一直比较迷茫的是,酶活计算要除以酶的质量,但是固载酶中酶的质量是怎么确定的呢?
我一直使用考马斯亮蓝测 ...

我当时也遇到这样的问题的。我的方法是一种是粗略计算,就是通过测量结合前后溶液里的酶的差值,计算出多少酶结合上去了,在计算出理论的多少载体上结合了多少的酶。第二个是把结合的酶高温变性,以SDS去跑胶,在再用其他标准的蛋白去做标准曲线,用凝胶成像仪的相对定量的方法来测试。
说实在的,酶量测量本来就是粗略的。在不影响实验结论的情况下,我觉得都可以吧。
这个实验还是很难做的。我做的也不好,所以只能参考下我的做法,还需要再深思熟虑~~
o(╯□╰)o
68楼2016-08-12 15:24:34
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yang2325182(金币+1): 谢谢参与
6楼2016-01-04 23:06:50
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yang2325182(金币+1): 谢谢参与
8楼2016-01-04 23:10:56
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yang2325182(金币+1): 谢谢参与
9楼2016-01-04 23:13:42
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