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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » dmol3算出来的能垒是负值?
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windowtt

铜虫 (小有名气)

[求助] dmol3算出来的能垒是负值? 已有1人参与

请问，dmol3算出来的能垒是负值，怎么理解？合理吗？
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1楼 2016-01-03 16:29:00
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windowtt

铜虫 (小有名气)
论坛里能搜到一些相关的，却打不开，是时间久了的缘故吗？
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2楼2016-01-03 16:33:46
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windowtt

铜虫 (小有名气)
希望各位不吝赐教！
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3楼2016-01-03 16:44:38
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happylbg

木虫 (小有名气)
outmol里面的能垒是负值？

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-01-03 18:13:15
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windowtt

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by happylbg at 2016-01-03 18:13:15
outmol里面的能垒是负值？

是的
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5楼2016-01-04 08:47:06
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windowtt

铜虫 (小有名气)
这是计算结果：
Summary of TS calculation
     Energy of reactant           :      -3662.3382860 Ha     反应物没有优化
     Energy of product            :      -3662.4013419 Ha
     Energy of transition state   :      -3662.3744296 Ha
     Location of transition state :            0.45995
     Energy of reaction           :            -39.568 kcal/mol
     Energy of barrier            :            -22.680 kcal/mol
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6楼2016-01-04 08:50:25
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windowtt

铜虫 (小有名气)
过渡态能量小于反应物的
我想知道，这种情况合理么？
是可以存在的吗？
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7楼2016-01-04 08:53:46
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cas_hzj

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-01-06 20:43:47
搜寻过渡态，需要对初态和末态的模型进行几何结构优化，然后进行过渡态搜寻
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8楼2016-01-04 09:03:54
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windowtt

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by cas_hzj at 2016-01-04 09:03:54
搜寻过渡态，需要对初态和末态的模型进行几何结构优化，然后进行过渡态搜寻

嗯嗯 谢谢你的回复
不过我想初态未优化只是影响能垒高度吧，符号会影响吗？
初态优化的结果-3662.3519010ha
所以还是存在，若能垒为负是否合理的问题。
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9楼2016-01-04 09:11:10
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windowtt

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by cas_hzj at 2016-01-04 09:03:54
搜寻过渡态，需要对初态和末态的模型进行几何结构优化，然后进行过渡态搜寻

嗯嗯 我现在已重新提交初态优化后的TS计算 希望看到不一样的结果
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10楼2016-01-04 09:17:58
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