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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] 进化树分析的问题已有1人参与

我看文献上,有一种做法:同时用了5个看家基因,通过MLST比对后构建了进化树。
这种进化树如何实现的?
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20084787

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
构建系统进化树的时候,你可以把需要进行比较的基因全部放进去,先把每个基因的氨基酸序列进行比对,再用MEGA软件构建系统进化树,构建的时候你可以选择其中一个基因作为根。建树方法跟常规的建树方法一致,只需要把你需要构建的序列放到一起比对。希望能让你满意,如有不同观点可以再交流。
努力奋斗吧,人生会更精彩…
2楼2015-12-31 15:05:10
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dujuan2016

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 20084787 at 2015-12-31 15:05:10
构建系统进化树的时候,你可以把需要进行比较的基因全部放进去,先把每个基因的氨基酸序列进行比对,再用MEGA软件构建系统进化树,构建的时候你可以选择其中一个基因作为根。建树方法跟常规的建树方法一致,只需要把 ...

你好,我最近在做MLST分型,每个菌做了7个管家基因,相当于有7条序列,然后想以这七条序列得到的ST型进行建树,请问,我怎么进行建树呀?我用MEGA、DNAMAN等软件出来的树都是分7条序列的,没有整合到一块,所以相问问该怎么做?非常感谢!
3楼2018-05-31 10:16:12
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