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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 进化树分析的问题
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lmzxcom1

金虫 (著名写手)

[求助] 进化树分析的问题 已有1人参与

我看文献上，有一种做法：同时用了5个看家基因，通过MLST比对后构建了进化树。
这种进化树如何实现的？
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1楼 2015-12-31 09:41:51
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20084787

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
构建系统进化树的时候，你可以把需要进行比较的基因全部放进去，先把每个基因的氨基酸序列进行比对，再用MEGA软件构建系统进化树，构建的时候你可以选择其中一个基因作为根。建树方法跟常规的建树方法一致，只需要把你需要构建的序列放到一起比对。希望能让你满意，如有不同观点可以再交流。
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努力奋斗吧，人生会更精彩…
2楼2015-12-31 15:05:10
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dujuan2016

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 20084787 at 2015-12-31 15:05:10
构建系统进化树的时候，你可以把需要进行比较的基因全部放进去，先把每个基因的氨基酸序列进行比对，再用MEGA软件构建系统进化树，构建的时候你可以选择其中一个基因作为根。建树方法跟常规的建树方法一致，只需要把 ...

你好，我最近在做MLST分型，每个菌做了7个管家基因，相当于有7条序列，然后想以这七条序列得到的ST型进行建树，请问，我怎么进行建树呀？我用MEGA、DNAMAN等软件出来的树都是分7条序列的，没有整合到一块，所以相问问该怎么做？非常感谢！
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3楼2018-05-31 10:16:12
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