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daycooler

新虫 (小有名气)

[交流] 2-DE 后MALDI TOF/tof 图谱求大神帮看看到底该怎么选择鉴定的蛋白质。 已有3人参与

本人新人，在做MALDI时候遇到了很多问题，请大神们帮帮忙解答一下。在做MALDI时候，角蛋白混入了其中，鉴定出来了好几种蛋白质，对于这几种蛋白质我要怎么选？中间那个假定蛋白是不是受到了角蛋白的影响而出来了的？做出的图谱评分都很低，不知道该怎么办。如果要选择蓝色箭头的那个蛋白，是不是要去比对同源序列？

2-DE 后MALDI TOF/tof 图谱求大神帮看看到底该怎么选择鉴定的蛋白质。
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1楼 2015-12-30 21:26:39
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北国佳人

铜虫 (小有名气)
★
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我先前做过，，分值低，峰图信号不高的，都毙掉，。。。有时峰图信号很高，比对出来分值低，这时认为是假阳性
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努力的小蜜蜂
2楼2016-01-01 15:55:47
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s_lich28

铜虫 (初入文坛)
★
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建议手动选峰，同时加上胶上的空白对照（没有spot的地方），把你spot特有的峰输入MASCOT检索
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There is nothing either good or bad, thinking makes it so.
3楼2016-01-03 05:17:03
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wyy5522

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
图谱结果不能用，重做。
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4楼2016-01-06 16:59:43
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