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xzxueren

铜虫 (正式写手)

[求助] 有关“吸收和发射光谱TDDFT计算”的审稿意见的疑惑

最近投了篇稿子,做的是荧光探针分子吸收和发射光谱TDDFT计算。审稿意见有一条如下,有点迷惑,特请教大家。

3) When the absorption spectra is calculated usually it is ignored the vibronic substructure of electronic levels. In other words the energy of so-called 0->0 transition is calculated, which not always correspond to maxima of first absorption band observed in the experiment. It may happens that the absorption maxima correspond to e.g. 0->1 or even 0->2 transition. If the latter one is true then comparison of calculated and measured spectra is less accurate. Author should check this and mention in the manuscript.

我们知道通常TDDFT算的是垂直吸收和发射,与实验的最大吸收和发射近似对应。当然如果要更直接的去比较,最好算0->0跃迁。根据上面的审稿意见,如何判断到底是0->0,还是0->1或0->2跃迁呢?要去算振动分辨的电子光谱(Vibrationally-resolved electronic spectra)?有点迷惑,特请教大家。
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小范范1989

木虫 (著名写手)

我的理解:
我们计算的电子能谱,UV-abs吸收谱是电子态之间的光谱,没有考虑振动能级。至于跃迁到那个振动能级,我们也不知道。
也就是审稿人说的这个:absorption spectra is calculated usually it is ignored the vibronic substructure of electronic levels。
但是我不知到你文中是怎么写的,审稿人会问震动能级的跃迁?

我知道算振动分辨的电子光谱,涉及到激发态频率的计算,这个如果你的分子稍大一点就很难算。
震动分辨的电子光谱,可以用fcclass计算,以及fc因子。
我是个小菜鸟,我不太懂哈,只是个人见解,望指点。
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2015-12-30 16:19:34
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xzxueren

铜虫 (正式写手)

谢谢指点,我感觉可能是审稿人把我的结果当做是0-0跃迁能了,所以要我明确一下。因为我在文中并未特别说明计算的是垂直跃迁能。

(怎么无法进行金币奖励呢,提示回帖不是应助贴,送红花把)
3楼2015-12-31 11:42:02
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1032871617

金虫 (著名写手)

如何把事情做到最好

引用回帖:
3楼: Originally posted by xzxueren at 2015-12-31 11:42:02
谢谢指点,我感觉可能是审稿人把我的结果当做是0-0跃迁能了,所以要我明确一下。因为我在文中并未特别说明计算的是垂直跃迁能。

(怎么无法进行金币奖励呢,提示回帖不是应助贴,送红花把)

支持Freakshare Rapidgator Hotfile Keep2share Ryushare Filepost Lumfile Bitshare Filefactory Extabit Netload Uploaded.to Ul.to Ctdisk 等主流网盘
不必多言
4楼2015-12-31 15:28:32
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virtualzx

木虫 (著名写手)

0->0是绝热跃迁不是垂直。这就是他要说的。

振动结构只要基态激发态分别计算hessian然后计算Franck-Condon因子就可以了。

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-12-31 23:05:59
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