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amber处理蛋白
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在amber中处理蛋白的时候，如果下载下来的蛋白中有两个配体小分子，两个之间有一定的相互作用，提取其中一个作为配体，另一个保持不变。 做成复合物，在amber中进行处理，对提取出来的配体小分子进行相应的处理，那么另一个保持不变的小分子要不要处理？要进行怎样的处理呢？tleap的时候保持不变的那个小分子报错。 |
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