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daojunzh

银虫 (正式写手)

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[交流] SSR标记跑８%的非变性PAGE胶，求解如下问题

各位同行，SSR标记跑８%的非变性PAGE胶，出现如下问题：１、为何样品经过的路线染色后背景颜色都很深，如图黑色剑头所示？２、如图黑色剑头所示，为何这些样品经过的路线在这些地方都变大了，且背景颜色都很深？以１５０V电压跑１小时２０分钟，电泳槽为六一的３０C。谢谢！

SSR电泳图.jpg

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1楼 2015-12-28 01:02:35

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liyan974

新虫 (初入文坛)

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专业: 设施园艺学

★
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1、样品经过的路线染色后背景颜色深应该是扩增的问题，有碎带
2、样品经过的路线在这些地方变大，我的情况类似，是最下边变大，带上面较直，最下边鼓起来。我怀疑是胶凝的不好，凝的慢常出现这种情况，加大AP和TEMED的量，让胶很快凝，这种情况少一点，另外可以降低电压，慢些跑也会好一点
希望有所帮助，也希望高手过来指点

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2楼2016-01-22 16:39:14

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杨晨

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注册: 2005-12-04
性别: GG
专业: 作物分子育种

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这种情况可能是由于所提取的DNA纯度不够，可能要优化DNA提取程序或者纯化DNA。提取DNA的组织可能是一些含多糖有机物比较多的材料。

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3楼2016-01-22 23:05:19

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