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daojunzh

银虫 (正式写手)

[交流] SSR标记跑8%的非变性PAGE胶,求解如下问题

各位同行,SSR标记跑8%的非变性PAGE胶,出现如下问题:1、为何样品经过的路线染色后背景颜色都很深,如图黑色剑头所示?2、如图黑色剑头所示,为何这些样品经过的路线在这些地方都变大了,且背景颜色都很深?以150V电压跑1小时20分钟,电泳槽为六一的30C。谢谢!

SSR标记跑8%的非变性PAGE胶,求解如下问题
SSR电泳图.jpg
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liyan974

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1、样品经过的路线染色后背景颜色深应该是扩增的问题,有碎带
2、样品经过的路线在这些地方变大,我的情况类似,是最下边变大,带上面较直,最下边鼓起来。我怀疑是胶凝的不好,凝的慢常出现这种情况,加大AP和TEMED的量,让胶很快凝,这种情况少一点,另外可以降低电压,慢些跑也会好一点
希望有所帮助,也希望高手过来指点
2楼2016-01-22 16:39:14
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杨晨

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这种情况可能是由于所提取的DNA纯度不够,可能要优化DNA提取程序或者纯化DNA。提取DNA的组织可能是一些含多糖有机物比较多的材料。
3楼2016-01-22 23:05:19
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