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zhangguangping木虫 (著名写手)
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用VESTA做VASP的差分电荷密度图 已有5人参与
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转自:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=9046086&fpage=1 本帖子的内容来自于上面帖子中的附件。为了方便大家比较直接的看到,而不用下载附件,故重复发帖。@Jiansh 用VESTA 做VASP差分电荷(C-A+B)图方法: 1、导入 C 的CHGCAR(拖拽到vesta)面板框中 2、Edit——>Edit data——>Volumetric Data————>Import (选择A 的CHGCAR)——>Subtract from current data——>OK 3、Edit——>Edit data——>Volumetric Data————>Import (选择B 的CHGCAR)——>Subtract from current data——>OK 注意:A,B,C三个文件的格点要一一对应。 (后来发现,http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4287522&fpage=1 这个帖子也不错,很详细 @沙风) =============== 转自:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7392808&fpage=1中的 “电荷密度差的计算.doc” @gulangyu 本文中提到电荷密度差,有时也称为差分电荷密度。 这里主要是讨论在VASP中如何得到用来分析成键前后电荷转移的电荷密度差。 此时电荷密度差定义为:delta_RHO = RHO_sc - RHO_atom 其中 RHO_sc 为自洽的面电荷密度,而 RHO_atom 为相应的非自洽的面电荷密度,是由理想的原子周围电荷分布堆彻得到的,即为原子电荷密度的叠加(a superposition of atomic charge densities)。 不同晶面的 RHO_sc 可由自洽计算的CHG或CHGCAR得到; 而计算 RHO_atom 所需的 CHG 或 CHGCAR 可由下述非自洽计算得到: 仍使用原来自洽计算时的四个输入文件,但INCAR中需要设置 ICHARG=12 和 NELM=0,其他设置不变。 需要特别注意的,应保持前后两次计算(自洽和非自洽)中的 FFT-mesh 一致。因为,只有维数一样,我们才能对两个RHO作相应的矩阵相减。不过,只要按上一段提到的设置方法做就行了,无须特别增加别的设置。 获得了RHO_sc和RHO_atom的CHG或者CHGCAR文件之后,可以利用开始提到的办法,用VESTA很容易做出电荷密度差。 |
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