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wwm09

金虫 (小有名气)

[求助] 如何在VASP中给出过渡态的结构?

就是我设计了始态与末态的结构,在VASP中应该能画出多个(比如5)介于始态和末态的中间结构,这些中间结构的原子位置似乎是以始态和末态位置而线性变化的。我不记得是NEB还是numpy了,请问是怎样的代码能在VASP中实现这一功能?
谢谢
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youcanyouup
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wwm09

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 灰色的小白兔 at 2016-01-24 03:12:27
./nebmake.pl POSCAR.is POSCAR.fs 5   (需要nebmake.pl 和Vasp.pm文件)

谢谢,问题当时已解决,然后把这个帖子忘了半年了
youcanyouup
4楼2016-07-24 23:46:26
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查看全部 4 个回答

热望如鲸歌

金虫 (初入文坛)

师兄,请教一个问题,我在用NEB方法找过渡态时(完全自学),从官网上下载了压缩包,解压到服务器自己的工作目录下,按照官网的提示设置了INCAR,也准备好了POS,INCAR设置如下
  LPLANE = TRUE
  NSIM = 4
  NPAR = 1

  IALGO  = 48
  IBRION = 2
  
  NSW   = 100
  
  ISMEAR = 1
  SIGMA  = 0.1
  POTIM = 0.1

  PREC   = Normal
  EDIFF  = 1E-5
  EDIFFG = -2E-2
  
  ISPIN  = 1
  LREAL  = A
  ISYM   = 1
  
     
  LWAVE  = F
  LCHARG = F   
  NWRITE = 1

  IMAGES = 10

  ISIF = 3
  IOPT = 3
提交任务时失败,日志文件显示
running on   30 total cores
each image running on    3 cores
distrk:  each k-point on    3 cores,    1 groups。请问哪里需要修改 ,或者提示一下需要注意的地方。希望得到您的帮助
2楼2016-01-24 09:18:56
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灰色的小白兔

铜虫 (小有名气)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2016-02-17 11:59:21
./nebmake.pl POSCAR.is POSCAR.fs 5   (需要nebmake.pl 和Vasp.pm文件)

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3楼2016-01-24 23:12:27
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