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20095072040

木虫 (小有名气)


[资源] SRA数据上传参考教程

经过很长时间的摸索,终于把数据上传到了SRA,本想忙完这段时间自己写一个很详细的SRA数据上传的指南,怕有些朋友现在急着要用,就先把现在手里的资源给大家分享一下,供大家参考,NCBA上https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47529/这个讲解也是很有参考价值的。祝大家实验顺利,多发文章。
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青山脚下

银虫 (小有名气)


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6楼2016-06-24 20:25:47
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遥跃love

铁虫 (初入文坛)


您好,麻烦问一下,您建立BioSample时,在Attributes阶段时,没有出现Error么?我的一直说是Sample name有问题。一直红字标注显示Error: Your table upload failed because multiple BioSamples cannot have identical attributes. You should have one BioSample for each specimen, and each of your BioSamples must have differentiating information (excluding sample name, title, bioproject accession and description). This check was implemented to encourage submitters to include distinguishing information in their samples. If the distinguishing information is in the sample name, title or description, please recode it into an appropriate attribute, either one of the predefined attributes or a custom attribute you define. If it is necessary to represent true biological replicates as separate BioSamples, you might add an 'aliquot' or 'replicate' attribute, e.g., 'replicate = biological replicate 1', as appropriate. Note that multiple assay types, e.g., RNA-seq and ChIP-seq data may reference the same BioSample if appropriate.Sample name:……“我不知道怎么回事?想请教一下?十分感谢!
9楼2016-09-26 09:39:33
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遥跃love

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
7楼: Originally posted by od000888 at 2016-09-19 16:32:00
顶一下,感谢分享!

您好,您数据提交成功了么?
10楼2016-09-26 09:40:49
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SHeOI

新虫 (初入文坛)


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顶一下,感谢分享!最近在上传数据,很及时
14楼2016-10-26 16:12:55
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线粒体的忧伤

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
9楼: Originally posted by 遥跃love at 2016-09-26 09:39:33
您好,麻烦问一下,您建立BioSample时,在Attributes阶段时,没有出现Error么?我的一直说是Sample name有问题。一直红字标注显示Error: Your table upload failed because multiple BioSamples cannot have identi ...

您好,我也遇到了这样的问题,请问您是怎么解决的?跪谢~~~
17楼2016-11-13 15:54:32
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线粒体的忧伤

新虫 (初入文坛)


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楼主您好,我上传Biosanples的表格在Attributes那步遇到了问题。跟前面的那位的问题一样,能看下您的文件的格式吗?
18楼2016-11-13 15:57:54
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郝841866574

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢楼主分享
43楼2017-03-07 16:12:48
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JIGUOQING123

金虫 (小有名气)


引用回帖:
18楼: Originally posted by 线粒体的忧伤 at 2016-11-13 15:57:54
楼主您好,我上传Biosanples的表格在Attributes那步遇到了问题。跟前面的那位的问题一样,能看下您的文件的格式吗?

您的问题以解决了吗,我也出现了同样的问题
44楼2017-06-28 09:07:42
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2016-01-03 12:00   回复  
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顽象3楼
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SUISNOW22楼
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