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小小静子

新虫 (初入文坛)

[求助] NCBI比对结果那么多100%是怎么回事儿? 已有2人参与

NCBI比对结果出现那么多100%怎么回事儿?????

NCBI比对结果那么多100%是怎么回事儿?
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麦田——0410

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小小静子: 金币+1 2015-12-26 14:12:19
16S RNA高度保守,基因没有发生突变,正常啊。
平常心
2楼2015-12-25 11:36:11
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小小静子

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 麦田——0410 at 2015-12-25 11:36:11
16S RNA高度保守,基因没有发生突变,正常啊。

怎么会有那么多100%,而且都是不一样的,应该选择哪一个?
3楼2015-12-25 14:45:12
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麦田——0410

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小小静子 at 2015-12-25 14:45:12
怎么会有那么多100%,而且都是不一样的,应该选择哪一个?...

你这比对的结果显示都是醋酸菌的16S rRNA的部分序列(除了倒数第二个),都属于醋酸菌,只不过是不同的种,如果你要构建遗传进化树应该都选。而且你比对结果显示覆盖率(Query cover)和相似度(Ident)都是100%,所以你所选的任何一个都与你上传比对的序列是一模一样的。
平常心
4楼2015-12-26 16:59:39
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懒猫633

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

16s序列吧,,都是一个种的,选哪个都一样一样的
5楼2015-12-28 10:43:55
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小小静子

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 懒猫633 at 2015-12-28 10:43:55
16s序列吧,,都是一个种的,选哪个都一样一样的

谢谢
6楼2016-01-06 10:30:21
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