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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 在天河超算上提交任务出错求助！
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zyqh

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 在天河超算上提交任务出错求助！ 已有3人参与

最近在天河上提交任务做体系的结构优化，跑了几个离子步就出现了以下的错误，想请问下是什么原因？
slurmd[cn1062]: *** STEP 1033865.0 CANCELLED AT 2015-12-24T16:42:00 DUE TO TIME LIMIT ***
slurmd[cn1062]: *** JOB 1033865 CANCELLED AT 2015-12-24T16:42:00 DUE TO TIME LIMIT ***
yhrun: Job step aborted: Waiting up to 2 seconds for job step to finish.
yhrun: got SIGCONT
yhrun: forcing job termination
yhrun: error: Timed out waiting for job step to complete
谢谢！
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雨后方能见彩虹
1楼 2015-12-24 17:27:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-25 08:01:47
You guy is ridiculous. This error message has already told you it is "DUE TO TIME LIMIT" that you job get killed.
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

zyqh
2楼2015-12-25 03:21:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyqh

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2015-12-25 03:21:42
You guy is ridiculous. This error message has already told you it is "DUE TO TIME LIMIT" that you job get killed.

请问如何解决这个问题呢，谢谢！

发自小木虫IOS客户端
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雨后方能见彩虹
3楼2015-12-25 09:17:53
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emilyoyang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zyqh at 2015-12-25 09:17:53
请问如何解决这个问题呢，谢谢！
...

read the manual and the extend the walltime. I do not clearly remember which slurm command is used to set the walltime.
赞一下 回复此楼
4楼2015-12-25 11:31:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-27 09:01:05
正如楼上所说，提交任务的脚本设置的最大运行时间太小，超出了。设置的大一点。在walltime那个选项下面设置。如果你没有设置那个选项，就是采用的系统默认值。需要明确设置一下。
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弘德明志博学笃行
5楼2015-12-25 23:52:47
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不取俗名

木虫 (正式写手)
我记得脚本里面可以加一行设置成7200

发自小木虫Android客户端
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6楼2015-12-26 08:28:13
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jimsmart

捐助贵宾 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-01-06 21:02:05
有可能是网络传输数据上存在问题.
与管理员联系一下
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7楼2015-12-28 08:47:24
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jx在路上

金虫 (著名写手)
你好，我也出现了同样的问题。请问，我也出现yhrun: got SIGCONT，但是任务状态是R,表示在跑。这还会出数据吗，我的任务很大，出数据比较慢，我也不能判断到底会不会出数据。
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8楼2016-11-23 19:24:45
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